Op de site van Top500 staat het persbericht dat vandaag de 22e editie van de top 500 van 's werelds snelste supercomputers is uitgebracht. Het blijkt dat de door NEC gebouwde Earth Simulator voor de vierde keer op rij de lijst aanvoert met een Linpack benchmark-performance van 35,86 Tflops (biljoen berekeningen per seconde). Nieuw binnengekomen op de derde plaats is de cluster van 1100 PowerMac G5's gebouwd door VirginiaTech, waar wij al eerder over berichtten. Wat opvalt aan de lijst is dat het aantal clustersystemen gegroeid is van 149 naar 208 in vergelijking met een half jaar geleden. Hierdoor zijn geclusterde supercomputers de meest voorkomende soort in de lijst geworden. Gekeken naar de totale performance per fabrikant voert IBM nog steeds de lijst aan met zo'n 35 procent, tweede is HP met 22,7 procent en derde NEC met 8,7 procent:

The list of cluster systems in the TOP10 has grown impressively to seven systems. These systems are built with workstations or PCs as building blocks and often connected by special high-speed internal networks. The number of clusters in the full TOP500 grew also again strongly, now totaling 208 systems up from 149 six months ago. This makes clustered systems the most common computer architecture seen in the TOP500. The importance of this market can also be seen by the fact that most manufacturers are now active in this market segment.

C|Net komt met het bericht dat zowel Red Hat als SuSe Linux bezig zijn met het introduceren van kortingen op hun besturingssystemen voor studenten en educatieve instellingen. Red Hat heeft hiertoe twee nieuwe versies van zijn besturingssysteem voor Linux ontwikkeld, Red Hat Academic Desktop zal voor studenten voor slechts vijfentwintig dollar verkrijgbaar zijn, Red Hat Academic Server zal voor scholen zo' n vijftig dollar gaan kosten. Deze versies zijn momenteel alleen nog maar verkrijgbaar in de Verenigde Staten, het bedrijf hoopt echter voor het eind van het jaar deze diensten internationaal te kunnen aanbieden. Voor de beide versies zijn online software-updates verkrijgbaar, telefonische ondersteuning is echter niet bij de prijs inbegrepen.

SuSe is afgelopen woensdag begonnen met het met veertig procent verlagen van zijn Linuxdistributie. Met de verlaging van de prijzen hopen beide bedrijven weer in de gratie bij studenten te komen, die eerder afhaakten vanwege het feit dat voor de distributies van beide bedrijven betaald moest gaan worden. Analisten voorspellen een verdere groei van de computermarkt voor scholen, waardoor in 2006 9,5 miljard dollar in deze markt rond zou moeten gaan.

Maandag rond half drie is het precies vijftien jaar geleden dat Nederland als tweede land ter wereld op het National Science Foundation-net van de VS werd aangesloten. Piet Beertema van het Centrum Wiskunde en Informatica (CWI) in Amsterdam was de eerste Nederlander die een e-mail zonder enige vertraging uit de VS mocht ontvangen en mag zich daarmee internetpionier van Nederland noemen. In rap tempo volgden andere universiteiten en wetenschappelijke instellingen in Europa en in 1993 konden ook particulieren van het internet gebruik maken.

De belangrijkste toepassing van internet in die tijd was e-mail. Met behulp van e-mail konden wetenschappers over de hele wereld met elkaar communiceren en hun onderzoeken delen. Tegenwoordig is e-mail uitgegroeid tot een communicatiemiddel waar veel mensen niet meer zonder kunnen. Piet Beertema is er echter niet zeker van of e-mail nog over 15 jaar bestaat. Vooral spam is volgens hem een belangrijke bedreiging voor het voortbestaan van e-mail:

Anno 2003 is de toekomst van de enige internetapplicatie die volgens Beertema echt telt, in gevaar. Een overvloed aan ongewenste e-mail vormt een regelrechte bedreiging. Blijft het versturen van spam onbestraft dan is het de vraag of e-mail nog eens vijftien jaar haalt. De komende vijftien jaar van het wereldwijde web bieden volgens de systeembeheerder vooral meer van hetzelfde. "Meer, sneller en leuker."

New Scientist komt met het bericht dat de directeur van 321 Studios, het bedrijf dat XCopy op de markt brengt, denkt dat er een maas in de Europese copyrightwet zit. XCopy is een dvd-kopieerprogramma dat in staat is exacte kopieën te maken van beveiligde dvd's. De reden voor de interesse van de Amerikaan in de wet moge duidelijk zijn. In de Verenigde Staten procederen de filmmaatschappijen al tegen 321 Studios vanwege vermeende overtredingen van de DMCA en ditzelfde gaan ze nu doen in het Verenigd Koninkrijk onder de Europese wet. In artikel 296 van de wet staat dat het verboden is een beveiliging te omzeilen als deze beveiliging 'effectief' is. Dit betekent volgens de directeur dat het kopieerprogramma niet in overtreding is omdat de manier van omzeilen zó gemakkelijk is, dat de beveiliging niet 'effectief' is. Natuurlijk stellen de tegenstanders van 321 Studios dat dit een onzinnige verdediging is, maar een Engelse advocaat ziet wel wat in het argument:

But a legal expert contacted by New Scientist is not so sure. "The courts might well have some sympathy with 321's argument that protection is not effective if a schoolboy can defeat it," says Alistair Kelman, a barrister and computer expert with 25 years experience of copyright disputes.

Softwarereus Microsoft heeft een lijst gepubliceerd met de veiligsheidsmaatregelen die het tweede service pack voor Windows XP zal omvatten. De maatregelen zijn relatief uitgebreid en omvatten bescherming van het netwerk en het geheugen, veiliger e-mailverkeer en veiliger surfen. De eerste groep houdt een betere bescherming tegen netwerkaanvallen zoals Blaster in, onder andere door de beveiling rond RPC te verscherpen en de interne firewall standaard in te schakelen. Om te voorkomen dat gebruikers in de problemen komen door de firewall wordt deze zowel qua gebruiksinterface als qua compatibiliteit bijgeschaafd. Bescherming van het geheugen - de eerder besproken NX-technologie - omvat maatregelen tegen kwaadaardige software die zogenaamde buffer overruns veroorzaakt. Om het e-mailen veiliger te maken worden de standaard instellingen van Outlook Express strenger gemaakt en worden attachments strenger bekeken. Ook de standaard instellingen van Internet Explorer zullen strenger zijn. Mocht de gebruiker daar verandering in willen brengen, dan is het de bedoeling dat hij door een verbeterde interface voor de beveiligsopties niet per ongeluk meer open zet dan hij wil. De volledige lijst is hier te vinden.

We schrijven donderdag 13 november, de Dutch Power Cows doorbreken de barrière van 3.000.000 punten bij het project Genome@home. Met deze mijlpaal neemt DPC ruim drie procent van het totale ingeleverde werk voor haar rekening. Niet slecht voor een team uit zo'n klein kikkerlandje, zeker gezien het feit dat er ruim 1800 geregistreerde teams zijn.

Al sinds februari 2001 doet DPC mee met Genome@home en draait reeds lange tijd mee in de top. Nadat DPC op 11 oktober jongstleden twee teams op één dag inhaalde en daarmee de zevende positie bereikte, is nu dus ook de grens van drie miljoen gepasseerd. Hopelijk kunnen we nog lang en goed meedraaien in de top en ontdekken we wellicht een gene of proteïne die een medicijn oplevert voor een bepaalde ziekte.

Wat is Genome@home

Genome@home is een distributed computing project van Stanford University. Bij distributed computing wordt de ongebruikte processorkracht van duizenden pc's over de hele wereld ingezet om berekeningen uit te voeren. Voor dit project bestaan de berekeningen uit het ontwerpen van nieuwe genen.

Het doel van Genome@home is het ontwerpen van nieuwe genen die werkende proteïnen kunnen vormen in een cel. De cliënt gebruikt een computeralgoritme (SPA) gebaseerd op de fysische en biochemische regels waar genen en proteïnen zich naar gedragen, om nieuwe proteïnen (en daarmee nieuwe genen) te ontwerpen die nog niet zijn gevonden in de natuur. Door het vergelijken van deze "virtuele genomes" met degenen die gevonden zijn in de natuur, kunnen we beter leren hoe de natuurlijke genomes zijn geëvolueerd en hoe natuurlijke genen en proteïnen werken.

Een aantal belangrijke toepassingen van de Genome@home virtuele genome proteïne ontwerp database zijn:

• Ontwikkelen van nieuwe proteïnen voor medische therapie
• Ontwikkelen van nieuwe medicijnen
• Toekennen van functies aan de vele nieuwe genen die dagelijks worden berekend
• Leren begrijpen van proteïne-evolutie

Het ontwerpen van een enkele gene sequence vereist zeer veel computerkracht. Dus voor het ontwerpen van honderden nieuwe sequences voor honderden nieuwe proteïnen zijn letterlijk duizenden computers nodig. Door de ongebruikte computerkracht van vele thuiscomputers te benutten kan deze doelstelling toch gehaald worden.

Surf naar de Scientific Background pagina van de Stanford Universiteit voor meer informatie over de wetenschappelijke achtergrond van genomen, proteïnen en de relatie tussen proteïnen en genen.

De nieuw te verwachten client

Eerder dit jaar werd de oude Genome@home-cliënt uitgerangeerd door de komst van een nieuwe Folding@home-cliënt die zowel kan folden als genomen. Dit had helaas tot gevolg dat diverse DPC-ers met een beperkte internetverbinding niet meer zo makkelijk konden meedoen, omdat de nieuwe client niet beschikt over een zogenaamde 'no-net' functie.

Gelukkig kunnen we binnenkort een nieuwe versie van de Folding@home-cliënt verwachten die in staat is om meerdere genome workunits ineens op te halen van de server. Hierdoor kan er langer worden doorgewerkt voordat de resultaten moeten worden teruggestuurd via het internet. Een releasedatum is nog niet bekend, maar er wordt inmiddels druk getest met de prerelease-versie, dus er is goede hoop dat hij op korte termijn beschikbaar komt.

Wil je ook meedoen met Genome@home?

Kijk dan in de Genome@home FAQ voor meer info over hoe je kunt meedoen. Er zijn zowel grafische als console-cliënts beschikbaar voor Windows, Linux en MacOS. Je kunt ook altijd terecht in de hitparades die dagelijks op het forum verschijnen, zoals bijvoorbeeld de Genome@Home hitparade van 13 november.

Creative heeft een nieuw toetsenbord op de markt gebracht dat niet alleen beschikt over karakter- en functietoetsen, maar ook over 37 pianotoetsen. Het apparaat werkt als een MIDI-controller en heeft een totaal bereik van 104 toetsen doordat de toonhoogte met drie octaven verhoogd en verlaagd kan worden. Verder heeft de gebruiker de beschikking over regelaars voor het vasthouden van tonen en het veranderen van de pitch en het volume. Volgens Creative zijn de toetsen zeer gevoelig en reageren ze zo realistisch als bij een echt instrument. De muziektoetsen kunnen afgeschermd worden met een losse klep, waarna dat gedeelte als polssteun dient.

Uiteraard is het normale invoergedeelte van het toetsenbord compleet, inclusief extra toetsen met speciale, zelf in te stellen, functies. Dit gedeelte van het apparaat wordt met de pc verbonden via de PS/2-poort. Een USB-aansluiting is niet aanwezig. Wat software betreft wordt een reeks muziekprogramma's bijgeleverd, waarmee composities kunnen worden gemaakt en het keyboardspelen geoefend kan worden. De Prodikeys DM, zoals het apparaat is genoemd, is in beige en zwart verkrijgbaar voor zo'n 100 euro.

Het hing al een tijdje in de lucht maar nu is het bijna zeker: de nieuwe AMD-fabriek komt in Dresden, zo meldt Reuters. In de Oost-Duitse stad staat al de Fab30-fabriek van de processorgigant, die zal gewoon blijven bestaan. De bouw van de 1,1 miljard euro dure fabriek hangt vooral af van een commissie binnen het Duitse parlement die moet beslissen over het al dan niet toekennen van een lening van 336 miljoen euro aan AMD. Voor de Duitse regering zou het een goede zaak zijn, de fabriek creëert honderden nieuwe jobs voor Dresden en omgeving, waar het werkloosheidpercentage ongeveer 13% bedraagt. AMD zou ook op subsidies van meer dan 100 miljoen euro mogen rekenen. Eerder werd East Fishkill, nabij New York, overwogen als mogelijke locatie voor de fabriek.

We berichtten al een paar dagen geleden over de hoorzittingen van de Europese Commissie rondom de antitrust zaak tegen Microsoft. De Europese Commissie heeft voorgesteld dat het bedrijf komt met een versie van Windows zonder ingebouwde Media Player. Op deze manier zouden concurrenten zoals Quicktime en Realplayer een eerlijkere kans hebben om te concurreren met Microsoft. Het bedrijf wilde hier echter niet in meegaan, omdat een versie van Windows zonder Media Player naar eigen zeggen een niet-standaard besturingssysteem zou worden waarop diverse populaire programma's niet zouden werken. Een rivaal heeft op de laatste dag van de hoorzitting echter een versie van Windows XP Embedded zonder WMP laten zien in een poging om dit argument onderuit te halen. De resultaten van de driedaagse zitting zijn niet direct beschikbaar, in juni 2004 zal er een beslissing genomen worden:

Eventually, European Union hearing officer Karen Williams will send her evaluation to Competition Commissioner Mario Monti who will use it to help him rule after a five-year probe.

The European Union executive is expected to decide by the end of June 2004, but if Microsoft objects it could start a lengthy appeal to the EU's top court in Luxembourg.