Cookies op Tweakers

Tweakers maakt gebruik van cookies, onder andere om de website te analyseren, het gebruiksgemak te vergroten en advertenties te tonen. Door gebruik te maken van deze website, of door op 'Ga verder' te klikken, geef je toestemming voor het gebruik van cookies. Wil je meer informatie over cookies en hoe ze worden gebruikt, bekijk dan ons cookiebeleid.

Meer informatie

Door , , 36 reacties
Bron: Dutch Power Cows

Hoe noem je een horde op hol geslagen koeien? Precies, een stampede! Na het succesvolle verloop van de eerste Stampede, die gehouden werd gedurende de maand augustus van vorig jaar, kon een vervolg natuurlijk niet uitblijven. Augustus 2003 was voor velen, buiten de maand van zonnesteken, hittegolven en strandfeesten, ook de maand waarin veel DPC'ers hun idle CPU-kracht inzetten voor slechts één project. DPC doet momenteel actief mee aan zo'n 12 distributed computing projecten, maar deze maand lieten vele DPC'ers hun eigen project even links liggen om zich in meer of mindere mate te focussen op ECC2-109. Hoewel een aantal pc's te lijden had onder de aanhoudende hitte en daardoor niet de gehele dag aan bleven staan, hebben we toch die maand een monsterscore neergezet die sindsdien niet meer geëvenaard is.

Inmiddels zijn we in een nieuw jaar beland en is er binnen DPC, via stemming, besloten dat vanaf 14 januari aanstaande tot 13 februari de tweede DPC stampede los zal barsten. Ditmaal is er gekozen voor een meer medisch georiënteerd project: Distributed Folding. Ook bij dit project hopen we nu aan de rest van de wereld te kunnen laten zien hoe sterk we kunnen zijn wanneer de handen ineen geslagen worden!

* De wedstrijd

Ook deze keer staat er alweer een horde koeien te trappelen om los te mogen. Net zoals bij de vorige stampede zal er weer een wedstrijdelement aanwezig zijn. Dit houdt in dat individuen voor de duratie van de stampede zich aansluiten bij één van de speciale stampede teams. Het team dat aan het eind van de stampede de meeste resultaten heeft ingeleverd zal tot winnaar worden uitgeroepen van de stampede. Op dit moment zijn er vijf stampede teams, welke al druk bezig zijn met reclamecampagnes om maar zoveel mogelijk onschuldige zieltjes aan te trekken.

* Het project

Het Distributed Folding project wordt verzorgd door het Samuel Lunenfeld Research Institute, de Universiteit van Toronto en het Mount Saini Hospital, allen in Toronto, Canada. Het doel van het project is om te leren begrijpen hoe eiwitten vouwen. Een quote van de science-afdeling van de projectsite:

Proteins are the parts that make up the machinery of living cells. In order to really understand what a protein does, scientists need to know the 3-dimensional structure of the protein and understand how several proteins assemble into these living machines. By knowing how proteins behave, scientists can better understand how proteins misbehave and cause diseases. With the structures of proteins scientists can better create new effective therapeutics to treat myriad diseases.
Distributed Folding logo

Op dit moment worden eiwitstructuren op een hele dure, tijdrovende manier onderzocht, namelijk door met röntgenstralen de kristallen van eiwitten te onderzoeken. Het Samuel Lunenfeld Research Institute heeft berekend dat het honderden jaren zou duren om alle berekeningen computermatig uit te voeren die nodig zijn om precies het gedrag van een eiwit te voorspellen. Daarom heeft dit instituut een algoritme ontwikkeld waarbij de hoeveelheid werk wat minder wordt, en bovendien ondergebracht kan worden in parallelle processen. Hierdoor is de taak dus geschikt geworden om verdeeld te worden over meerdere computers.

In een notendop uitgelegd: de resultaten van het project worden door wetenschappers gebruikt om meer te weten te komen over het vouwen van eiwitten. Pas als duidelijk wordt wat er op moleculair gebied gebeurt wanneer twee eiwitten een interactie met elkaar aangaan is er een kans op het vinden van geneesmiddelen die deze ene interactie specifiek kan verhinderen of juist bevorderen, en dat kan dus het vinden van een oplossing betekenen voor veel ziektes.

* Meedoen

Dutch Power Cows logo De Dutch Power Cows doen actief mee aan dit project en organiseren nu dus van 14 januari tot 13 februari een “Stampede”. Op dit moment staan we dagelijks gemiddeld 7e van de wereld, en we hopen stiekem dat we tijdens de stampede elke dag op de eerste plaats wereldwijd komen te staan. Of dit gaat lukken is afhankelijk van hoeveel mensen er mee helpen, en jij kan één van die mensen zijn. Naast DPC'ers in hard en nieren zijn ook mensen voor wie distributed computing nieuw is van harte uitgenodigd om in deze massahysterie te participeren.

Wat moet je doen? Ga naar de downloadpagina waar alle clients staan. Kies er eentje uit die bij jou past en volg dan verder deze pagina uit de FAQ. Op deze manier moet het helemaal goedkomen. Als je de client up & running hebt maak je even een post in de stampede-draad op GoT waarin je je username (waarmee je bij het project bekend bent) vermeldt en het stampede-team waar je bij wilt horen. Wij zorgen dan dat je voor dat team mee gaat doen aan de stampede.

Het enige wat je dan nog moet doen is zoveel mogelijk computers zoeken die aan dit project hun idle CPU-tijd kunnen bijdragen en ze onder jouw account laten meedoen. Zo help je niet alleen de Dutch Power Cows in de 'strijd' met de overige teams, maar draag je ook je steentje bij aan een verantwoord medisch doel!

Lees meer over

Gerelateerde content

Alle gerelateerde content (25)
Moderatie-faq Wijzig weergave

Reacties (36)

Het zoeken naar de ontwikkeling van eiwitten klinkt me wat belangrijker dan een sleutel kraken of naar buitenaards leven zoeken.
Daarom zit ik al een tijdje bij Folding.

Er moeten wel even wat leden bijkomen voor de Dutchpowercows, we staan nog maar op rank 22.
http://folding.stanford.edu/teamstats/team92.html
Buiten het feit dat ik het helemaal met je eens ben, (zelf ben ik vervend THINK'er), nog een ander punt. DPC staat dan misschien nog maar 22, maar met een daggemiddelde met gemiddeld de 7e plaats klopt daar natuurlijk niets van. Tijd dus om met een stampede deze 2 even gelijk te trekken.

Misschien dat ik mijn THINK hooibalen ook wel inwissel voor wat DF krachtvoer.
Je haalt (niet als enige) Folding@Home en Distributed Folding door elkaar. Bij Folding@Home staan we inderdaad op stekkie 22 terwijl bij Distributed Folding (het onderwerp van deze stampede) de DPC op plek nummer 7 staat
ALs we nou buitenaards leven zouden vinden en die zouden ons even vertellen hoe eiwitten zichzelf vouwen :z
Het is toch veel beter aan een medisch project mee te doen dan aan zo'n search nr buitenaards leven niet? Aan Dfolding hebben we in de toekomst nog iets :) hopelijk
Het is dus eindelijk weer zover: de Stampede. De aanloop is niet geheel zonder horten en stoten gegaan, er waren twee polls voor nodig, waarbij de eerste (waarbij een project, een datum en een regel voor joiners) half in de wind geslagen was. De eerste uitslag was Seventeen or Bust als project en 1 januari 2004 als startdatum, maar uiteindelijk zijn deze twee toch beide veranderd.

Nadat bekend was dat er vals gespeeld was (bij het stemmen werden valse en niet bestaande nicks gebruikt) moest er in een draadje gestemd worden op een project, SoB of Distributed Folding, omdat deze vrijwel het grootste aantal stemmen hadden. Het werd een nek-aan-nekrace, maar uiteindelijk kwam Distributed Folding met 38 tegen 35 als beste uit de bus.

Toen was er nog onenigheid over de startdatum. Volgens de poll had De Stampede op 1 januari moeten starten, maar omdat dat problemen zou opleveren voor mensen die computers op hun werk aan het werk moeten zetten levert dit een probleem op. Mede hierdoor is besloten om op 14 januari te gaan grazen.

Iedereen die dit stuk gelezen heeft: twijfel niet. Doe allemaal mee aan De Stampede om de Dutch Power Cows hogerop te helpen.
Kick :P

Zie vorige reactie :)
Best wel geinig dat juist folding@home op dit moment gebruikt maakt van de gromac engine, die inderdaad door medewerkers van de universiteit van Groningen is ontwikkeld.
Het schijnt dat dit een van de meest efficiente engines is op dit moment beschikbaar.
Ook wordt er gewaarschuwd dat mensen met een AMD erg goed moeten opletten of de koeling van hun processor wel goed is.
Het schijnt namelijk dat deze engine ietse te goed het onderste uit de kan haalt waardoor AMD processoren bloedheet worden.
Het is dus ook een goede burn-in test schijnbaar (-;
Folding@home (F@H)is niet gelijk aan Distributed Folding (DF). De stampede vindt dan ook plaats bij DF. Het moge dan beide onderzoeken naar het vouwen van eiwiteen zijn, maar daar houdt de overeenkomst dan ook zo'n beetje op. Nu is het mij om het even of het Folding@home was geworden, dat is ook een medisch project.

Voor diegenen die mee gaan doen. Lees a.u.b eerst de readme1st.txt. Er worden veel vragen in de DPCH gesteld waarvan de antwoorden daarin vermeld staan. Ook kun je de DPCH's van de afgelopen maand napluizen of je vraag erin behandeld wordt. Ik denk dat zo'n beetje alles nu wel een paar keer aan bod is geweest.

edit:
Ik heb de linkjes naar de projecten er even in vermeld + kleine toevoeging
mja..

ik heb ook wel een koe draaien.. maar geen flauw idee hoe ik dat kut ding moet configen of hoe je een team joint

Vraag me ook af waar die koe mee bezig is, cpu is 100% dus ik neem aan dat het wel goed zit ;)

misschien handig om een duidelijke site te maken waar in duidelijk nederlands uitgelegt staat.

misschien is het er, maar ik kon het niet vinden.
Nu vraag ik me af.
Ik zie dat er dus eigenlijk 2 folding projecten zijn.
Kan ik folding@home nou ook gebruiken voor DistributedFolding ? Het doel is hetzelfde, eiwit ontwikkeling berekenen, maar ze hebben ieder een eigen site.
M.a.w als DF anders is, kan ik nu al mijn clients verwijderen en de goeie installeren, eigenlijk heb ik daar niet zo';n zin in... :( maar het moet maar denk ik.
DistributedFolding is idd een ander project als Folding@home. En je zal idd je clients moeten verwijderen als je mee wilt stampen.
Ik doe nu ook mee. Echter een klein vraagje. Hoe komt het dat er maar 50% cpu belasting is? Bij andere projecten heb ik normaal een 100% cpu belasting. Zijn er manieren om em harder te laten lopen?
Dat heb ik ook. Bij mij komt het omdat ik een P4 met hyperthreading gebruik ...

* 786562 berend_engelbrecht
berend_engelbrecht denkt dat er niks aan te doen is, hyperthreading kan je niet zomaar even afzetten
ja hoor, dat kan je gewoon in je bios uitzetten hoor
dan start je de client twee keer :)
Goed idee. Ik zag dat je met dfGUI ook heel eenvoudig 2 system services kan configureren. Ik ga het proberen :)

* 786562 berend_engelbrecht
edit:
Werkt als een speer... als de PC niks anders te doen heeft schieten ze allebei naar 49% CPU. En het gebruikt lekker veel RAM zo, 2x 95 MB 8-)
Mss beetje off-topic, maar waarom staan er 6 suikers in het logo van DF, terwijl het over eiwitten gaat!
Omdat het gevouwen papieren kraanvogels zijn volgens mij.
Jeppes ik draai ik DF, subteam B1tchin Boeskool.
Wordt vandaag waarschijnlijk een record gevestigd voor DPC met 100 flushende members. In december was dat nog rond de 50
En toen was het al redelijk gegroeid. Ik kan me nog herinneren dat we moeite hadden op de top 30 gevuld te krijgen. :7

Op dit item kan niet meer gereageerd worden.



Apple iOS 10 Google Pixel Apple iPhone 7 Sony PlayStation VR AMD Radeon RX 480 4GB Battlefield 1 Google Android Nougat Watch Dogs 2

© 1998 - 2016 de Persgroep Online Services B.V. Tweakers vormt samen met o.a. Autotrack en Carsom.nl de Persgroep Online Services B.V. Hosting door True