Op de lancering van de Google Desktop-zoekmachine zijn bezorgde reacties gekomen met betrekking tot de privacy, zo schrijft The Register. De waarschuwing dat het een 'privacy disaster' in de maak is, komt van concurrent David Burns, CEO van Copernic. Google slaat immers precies op welke bestanden zich op een computer bevinden, niet iets wat bijvoorbeeld gebruikers van p2p-netwerken graag in de verkeerde handen zien belanden. Volgens Burns kan het vanuit de gebruiker aantrekkelijk lijken om desktop en web-gegevens op dezelfde manier te doorzoeken maar hebben grote merken eerder bezwaar gemaakt toen Copernic die koppeling wilde aanbieden.
Volgens The Register is het voor gebruikers van Google Desktop niet mogelijk om het verzenden van informatie naar Google compleet uit te schakelen, al kunnen zij wel ervoor kiezen om het verzenden van 'detailed usage data' uit te schakelen. Google zelf ziet de vermenging van offline en online als een mooie manier om het gebruik van de website te vergroten en meer advertentieinkomsten binnen te halen. Ook op Slashdot wordt gediscussieerd over Google Desktop als spyware, al blijkt uit reacties dat de meeste mensen die suggestie overdreven vinden.