De Europese Commissie heeft een formele klacht ingediend tegen Apple en een aantal grote platenmaatschappijen omdat zij aan de verkoop van muziek in Europa niet toegestane beperkingen opleggen.
Steen des aanstoots voor de EC is het feit dat consumenten alleen bij de iTunes-vestiging in hun eigen land muziek kunnen kopen, en niet bij een vestiging in een ander EU-land. De EC startte in 2005 een onderzoek naar iTunes naar aanleiding van een klacht van een Britse consumentenorganisatie. Die beklaagde zich erover dat nummers op iTunes in Groot-Brittannië duurder waren dan in Frankrijk en Duitsland. Daar betalen consumenten 99 eurocent voor een nummer, terwijl dit in Groot-Brittannië het hogere bedrag van 79 pence is, omgerekend ruim 1,1 euro. Apple heeft verklaard dat het bedrijf ook liever één iTunes-winkel voor de hele EU had gehad, maar dat de platenmaatschappijen hier geen toestemming voor wilden geven. Volgens de EC heeft de klacht geen betrekking op de volgens sommigen te dominante marktpositie van iTunes, en al evenmin op het gebruik van digital rights management.