Update 1.2 voor Fallout 4 belemmert de onofficiële ondersteuning van mods in de game. Ook is de verborgen Data files-knop uit de launcher gehaald. De community van de game wist omwegen te verzinnen om het probleem weer op te lossen.
Het probleem met de nieuwste update lijkt te liggen bij het feit dat de launcher het plugins.txt-bestand waarin de te laden mods vastgelegd worden, iedere keer bij het opstarten schoonveegt. Plugins.txt is te vinden onder %appdata%\Local\Fallout 4\. In dit bestand staan de .esp-bestanden van de mods die Fallout 4 moet laden op een rijtje. Mogelijk lijden simpelere mods die geen .esp-bestanden hebben dus niet onder het probleem. Officieel ondersteunt Fallout 4 nog geen mods, maar de mogelijkheid zit wel gewoon in de engine van de game. De creation kit die de mods faciliteert, brengt Bethesda in 2016 uit, heeft het bedrijf eerder laten weten.
Een van de omwegen hiervoor lijkt te zijn om het plugins.txt-bestand na installatie of, indien nodig, herinstallatie van mods de 'alleen lezen'-eigenschap mee te geven. Bij deze werkwijze moet wel iedere keer als er iets aan de mod-selectie van een gebruiker verandert, 'alleen lezen' uit- en aangezet worden. Omdat Fallout4Launcher.exe verantwoordelijk is voor de reset van plugins.txt kan het probleem ook omzeild worden door direct Fallout4.exe te starten met behulp van bijvoorbeeld de Fallout 4 Script Extender, die veel modgebruikers toch al in huis hebben. Ook het gebruik van Fallout4Launcher.exe van vorige versies kan werken. De fixes worden gemeld op de fora van Bethesda en Nexus Mods.
Het probleem doet zich niet voor bij gebruikers van het bètakanaal van Fallout 4, die op versie 1.2.37 zitten. Hierbij is ook al de Data files-knop uit de launcher gehaald. Wie bijvoorbeeld de Nexus Mod Manager gebruikt, kan zonder deze knop toch zijn mods gemakkelijk installeren en gebruiken. Om de modfunctionaliteit bij Fallout 4 in te schakelen, zijn wat handmatige aanpassingen van bestanden vereist. Hiervoor hebben meerdere spelers instructievideo's gemaakt. De Xbox One- en PS4-versies krijgen in 2016 ook mod support.
Update 1.2 moet zorgen voor stabiliteitsverbeteringen, prestatieverbeteringen in bepaalde omgevingen en bugfixes. Ook kunnen nu numpad-toetsen functies toegewezen krijgen.