De krasgevoeligheid van de iPod nano leidt tot veel klachten van gebruikers van het apparaatje. Zoveel aandacht als de introductie van de mediaspeler kreeg, zoveel publiciteit kunnen inmiddels ook de krassen op het display verwachten. Op het forum van Apple zijn momenteel al meer dan 640 reacties binnengekomen in het topic over het probleem, relatief veel in vergelijking met de andere topics. Sommige gebruikers vermoeden dat Apple gekozen heeft voor een te zacht materiaal om het LCD-scherm te beschermen.
Tegenover The Register zei Apple in een eerste reactie dat voor de platte iPod harde polycarbonaat wordt gebruikt, dat misschien bekrast zou kunnen worden door sleutels. Dat de iPod nano niet bedoeld is om op te bergen in een kleine zak, lijkt echter niet door Apple volgehouden te kunnen worden. Steve Jobs toverde immers het apparaat uit zijn zak bij het voorstellen ervan, begin september. Een officieel standpunt heeft het bedrijf nog niet ingenomen en vooralsnog wordt er geen oplossing aangeboden. Het lijkt onwaarschijnlijk dat Apple zich stil houdt, nu ook in de media uitgebreid wordt bericht over de klachten. Overigens blijkt de iPod nano op andere vlakken wel bestand tegen een stootje: het apparaat was bijna onverwoestbaar toen Ars Technica de iPod aan een crashtest onderwierp.