De eerste Nightly van CyanogenMod 13 is verschenen op de officiële website van de ontwikkelaar. Dat biedt gebruikers nu het eerste op Android Marshmallow-gebaseerde alternatief op OxygenOS 3 en betekent dat custom roms op basis van CyanogenMod nu ook gemaakt kunnen worden.
De eerste Nightly van CM13 voor de OnePlus 2 is te vinden op get.cm. Een Nightly-build van de rom is niet zo stabiel als een releaseversie, maar stabiel genoeg dat ontwikkelaar Cyanogen Inc. het besturingssysteem vrijgeeft voor gevorderde gebruikers die het liefst op de nieuwste versie van Android werken. Het feit dat CyanogenMod een Nightly publiceert voor de OnePlus 2 geeft ook aan dat nieuwe, stabiele versies van CyanogenMod 13 in de toekomst ook komen.
Het oorspronkelijke besturingssysteem van de OnePlus 2 is het bedrijf zijn eigen OxygenOS. De releaseversie voor de OP2, OxygenOS 2.2.1, is gebaseerd op Android 5.1.1. De definitieve versie van OxygenOS 3.0.1, gebaseerd op Android 6.0.1, is echter zo goed als af en is ook al te downloaden door gebruikers. Daaropvolgend is een ota-update naar 3.0.2 beschikbaar. Die is ook handmatig te downloaden. Cyanogen OS, een speciaal aangepaste versie van CyanogenMod voor onder andere OnePlus, is er niet voor de OnePlus 2. De samenwerking tussen de twee partijen liep spaak na de release van de OnePlus One, wat OnePlus destijds bewoog om zijn eigen Android-variant te ontwikkelen. CyanogenMod 13 is ook al beschikbaar voor de OnePlus One en de OnePlus X.