Volgens het marktonderzoekbureau iSuppli kost de Mac Mini 283 dollar om te maken. Hiervan nemen de productiekosten negen dollar voor hun rekening, terwijl de onderdelen $274 kosten. iSuppli baseerde zich bij deze berekening op een standaard Mac mini met een 1,25GHz processor, 256MB DDR333-geheugen en een 40GB harde schijf. Volgens Tom's Hardware Guide heeft iSuppli echter vergeten om ook de kosten voor onder andere het vervoer, de marketing en de software mee te nemen. Als deze wel worden meegenomen, dan zou het totaal op ongeveer $350 uitkomen. Ten opzichte van een verkoopprijs van $499 zou dat betekenen dat Apple ongeveer 30% winst maakt op een Mac mini. Een flinke marge voor een instapmodel.
iSuppli baseerde zijn berekening echter op de eerste Mac mini die verscheen met 256MB geheugen. Tegenwoordig wordt de Mac mini met 512MB geheugen geleverd. Dit zou op zich niet zoveel mogen uitmaken voor berekening, daar de huidige prijs van 512MB geheugen nagenoeg gelijk is aan de prijs van 256MB geheugen ten tijde van de introductie van de Mac mini. Daarnaast zou Apple volgens Tom's Hardware Guide ook flinke winstmarges hanteren voor uitbreidingen, waardoor de totale marge per verkochte Mac mini eerder in de buurt van 35% komt te liggen.
