De eerste Nightly van Cyanogenmod voor de OnePlus 3 verscheen op 23 juli online. Maandag kwam de derde Nightly van het besturingssysteem naar buiten op de officiële website van de CM-ontwikkelaar. De OnePlus 3 heeft van huis uit OxygenOS 3 aan boord.
Cyanogenmod 13 is gebaseerd op Android 6.0 Marshmallow, momenteel de laatste versie van Android. OxygenOS 3.2.1 voor de OnePlus 3 is ook gebaseerd op Android 6.0. Daarnaast zijn gebruikers van OxygenOS afhankelijk van OnePlus voor updates.
De rom is te downloaden bij Cyanogenmod.org en is zo'n 487 megabyte groot. Het is een Nighly-build, wat inhoudt dat de rom niet zo stabiel is als een releaseversie, maar stabiel genoeg dat ontwikkelaar Cyanogen Inc. het besturingssysteem vrijgeeft voor 'gevorderde' gebruikers.
Tevens is bekend geworden dat de OnePlus 3 vanaf 1 augustus in Europa ook in de kleur 'soft gold' verkrijgbaar is, naast 'graphite'.