In zijn missie staat Lincoln Clay er niet alleen voor. De CIA heeft er belang bij dat Marcano wordt uitgeschakeld, vandaar dat John Donovan Lincoln bijstaat. Ook Father James steekt waar nodig een handje toe, voor zover zijn vakgebied dat toestaat. Belangrijker zijn echter de drie bondgenoten die Lincoln in de eerste paar uur van zijn missie om zich heen verzamelt. Die associates bestaan uit Cassandra, Thomas Burke en Vito Scalleta. Cassandra is de baas van de Haïtiaanse gangs, Thomas Burke een dronken Ier met banden met de IRA en Vito Scalleta een Italiaanse maffioso die de stad Empire Bay heeft moeten verlaten nadat hij daar de lokale maffiabaas Falcone heeft vermoord. Klinkt bekend? Inderdaad: dat waren de gebeurtenissen in Mafia II, waarin Vito het hoofdpersonage is. Een leuke manier om zijn verhaal aan dat van Lincoln te koppelen dus.
Kickback
Het drietal speelt een belangrijke rol voor Lincoln, want de drie hebben iets dat hij zelf niet heeft: manschappen en mogelijkheden. Die heeft Lincoln nodig, want een stad innemen lukt alleen als je de stukken die je hebt veroverd ook in bezit kunt houden. Daarom wijst Lincoln steeds een van de drie aan om een door hem ingenomen handeltje voor hem te runnen. In ruil daarvoor zorgt de associate in kwestie ervoor dat het gebied behouden blijft, en Lincoln krijgt een klein deel van het financiële gewin als 'kickback'.
Door zijn partners meer eigendom te geven, gaat hun totale inkomen omhoog. Dat is belangrijk, want hoe hoger dat inkomen, hoe meer bonussen Lincoln ervoor terugkrijgt. Aanvankelijk gaat het om simpele diensten, zoals het leveren van een mobiele wapendealer of het langsbrengen van een auto als je er een nodig hebt, maar het gaat al snel verder. Zo levert Vito steeds sterkere en zwaarder bewapende gangsters die Lincoln kan oproepen als hij in moeilijkheden zit. Cassandra kan de telefoonlijnen plat laten leggen, zodat getuigen van Lincolns misdaden de politie niet kunnen bellen en vijanden geen versterking kunnen inroepen. Ondertussen kan Burke ervoor zorgen dat de politie even een oogje toe knijpt, waardoor Lincoln ongestoord zijn gang kan gaan. Hoe hoger het vertrouwen dat je hebt bereikt bij een associate, hoe langer die acties actief blijven. Daarnaast leveren de associates ook nieuwe wapens en upgrades, als onderdeel van de beloningen.
Dat brengt keuzes met zich mee. Telkens als Lincoln een paar 'rackets' heeft ingenomen en de capo die hoort bij een district heeft uitgeschakeld, moet hij dat district toewijzen aan een van de drie kemphanen. Natuurlijk vinden zij allemaal dat ze recht hebben op het gebied en zullen ze teleurgesteld zijn als je voor een ander kiest. Zaken om rekening mee te houden: hoeveel gebied bezit elk persoon al? Welke bonussen zijn nu binnen bereik, en welke zijn nog een stapje weg maar wel de moeite om naartoe te werken? En ook: welke bonussen zou je kunnen missen, mocht een van de associates zijn steun intrekken? Wiens mensen heb je gebruikt om de rackets in het gebied in kwestie in bezit te houden, en dus de tijdelijke leiding gegeven? Neem je die leiding af en draag je het gebied over, of zet je de logische vervolgstap? New Bordeaux heeft een gelimiteerd aantal gebieden, dus je kunt niet iedereen tevreden houden.
Klusjes opknappen
Een extra methode om je partners te paaien, is klusjes voor ze opknappen. Alle drie de personages hebben twee soorten zijmissies voor je. Voor Vito's organisatie moet je trucks uit de Bayou stelen en naar een van zijn opslagplaatsen brengen, terwijl Vito zelf ook nog een lijstje namen voor je heeft van mensen die je, als het even uitkomt, om mag brengen. De organisatie van Burke vraagt je moonshine uit de Bayou te vissen, terwijl je voor Cassandra droppingen met drugs moet onderscheppen en bij de Haïtiaanse gang moet afleveren. De missies hebben weinig om het lijf, anders dan dat je soms wat bewakers moet uitschakelen en vooral lange afstanden moet afleggen, maar de beloningen zijn welkom. De bonus aan inkomsten voor de betreffende associate kan hem net naar een volgend niveau tillen, en jou een nieuwe bruikbare bonus opleveren. Op deze manier bereikten wij bijvoorbeeld bij Cassandra de bonus waarbij haar mensen ervoor zorgen dat het rijgedrag van alle auto's wat verbetert. Toch handig.