De Europese Commissie heeft aangekondigd dat het de softwarepatentrichtlijn een stille dood zou laten sterven als er genoeg tegenstand is. De EC is dan ook niet van plan er een probleem van te maken als in het Europees Parlement beslist wordt de richtlijn te verwerpen. In dat geval zal de Commissie ook geen nieuw voorstel indienen, zo stelde commissielid Charlie McCreevy. Waarnemers zijn echter van mening dat dit een bedekte bedreiging inhoudt tegenover het parlement. Het Europees Parlement heeft namelijk nadrukkelijk om een nieuw voorstel gevraagd, maar de Commissie maakt met dit statement duidelijk dat het te nemen of te laten is en er geen aangepast voorstel zal komen. Daardoor zal het moeilijk worden om de richtlijn in zijn huidige vorm alsnog te blokkeren, omdat velen van mening zijn dat er op het einde van het parcours wel een richtlijn moet bestaan. Volgens het Oostenrijkse parlementslid Eva Lichtenberger wordt de hele discussie hiermee echter omgevormd naar een machtsstrijd tussen de Commissie, de Raad van ministers en het Parlement, in plaats van een inhoudelijke discussie over de standpunten.