Coronaonderzoek krijgt voorrang bij Nederlandse en Belgische supercomputers

De Nederlandse 'nationale supercomputer' Cartesius en de Belgische BrEniac zijn met voorrang beschikbaar voor wetenschappelijk onderzoek naar het nieuwe coronavirus en een vaccin tegen de covid-19-ziekte.

De ict-samenwerkingsorganisatie van onderwijs- en onderzoeksinstellingen van Nederland SURF biedt wetenschappers samen met de NWO een fasttrackprocedure aan om met voorrang van de high performance computing-faciliteiten van de organisatie gebruik te kunnen maken voor aan corona gerelateerd onderzoek. Het gaat dan onder andere om gebruik van de supercomputers Cartesius, het LISA-cluster en de HPC Cloud. Daarnaast leveren de organisaties op verzoek opslag, kennis en ondersteuning.

Om in aanmerking te komen, moet onderzoek aanvullend zijn op bestaande studies van het RIVM of de WHO en wetenschappers moeten beschrijven hoe hun werk bijdraagt aan beter begrip van covid-19 of de respons op de pandemie. Binnen drie dagen horen ze of hun verzoek is ingewilligd; de fasttrackprocedure loopt tot 30 juni van dit jaar.

Cartesius

Het is een van de projecten bij SURF in de strijd tegen corona. Het instituut draagt ook met gpu-rekenkracht bij aan Folding@home. Daarnaast is er een speciale covid-19-pagina op Openaccess.nl met tips voor het openstellen van onderzoek naar de ziekte online gezet en is SURF betrokken bij een FAIR Data Points-initiatief om data van coronaonderzoek in de juiste formaten beschikbaar te stellen voor bijvoorbeeld machinelearning en kunstmatige intelligentie.

Het Vlaams Supercomputer Centrum reserveert op zijn beurt twee maanden lang de helft van de rekencapaciteit van zijn BrEniac-supercomputer voor coronaonderzoek. Ook universitaire hpc-infrastructuur kan beschikbaar worden gesteld. Wetenschappers krijgen met voorrang toegang op basis van first come, first served. Ze moeten in hun voorstel specificeren hoeveel gelijktijdig te gebruiken nodes ze maximaal nodig hebben, evenals het geschatte geheugengebruik van een computingtask en de vereisten voor schijfopslag.

BrEniac

In Europees verband is het Partnership for Advanced Computing in Europe bezig om instanties in verschillende lidstaten samen te laten werken bij het openstellen van hpc-infrastructuur. Onder andere het Duitse Gauss Centre for Supercomputing, bestaande uit drie supercomputers, het Franse Grand équipement national de calcul intensif en het Ierse Ichec doen hieraan mee. In de Verenigde Staten is een consortium bestaande uit onder andere IBM, Amazon Web Service, Google Cloud, Microsoft en het Amerikaanse Departement of Energy begonnen om wetenschappers toegang te geven tot supercomputers en clouddiensten bij onderzoek naar het nieuwe coronavirus en covid-19.

Reacties (104)

[suomi]

Ik snap nog steeds niet helemaal hoe een supercomputer nou werkt. Het hardwaregedeelte snap ik wel, maar dan je hebt een vraag waarvan je het antwoord niet weet. Hoe komt die supercomputer tot een antwoord? Simuleert hij de physics in enorme getallen tot dat hij een antwoord vind wat Corona kan bestrijden?

Moet ik het meer zien als 4*X=16 waarbij de supercomputer dan X probeert te bereken? Dat je dus de gewenste uitkomst al weet maar alleen niet hoe je tot die uitkomst komt?

[sympa]

Virussen bestaan uit eiwitten. En dat zijn aminozuren die tot een lange keten zijn geregen. De lijst aminozuren staat in het virus-RNA. Maar hoe het eiwit zich opvouwt en wat de structuur is: een grote puzzel. Je kan dat eiwit proberen te kristalliseren en er röntgen-diffractiebeelden van maken. Maar om een duidelijk beeld te krijgen moet je hard rekenen.
Vervolgens kan je gaan uitrekenen hoe die eiwitstructuur zich verhoudt tot de menselijke cel. Hoe komen ze bij elkaar? Welk 'bolletje' botst het eerst en buigt het dan weg of wat?
En daarna kan je weer gaan denken: hoe kan ik dat mechanisme gaan verpesten. Zodat het minder goed werkt.
Maar dat RNA van het virus maakt ook eiwitten die bijvoorbeeld de afweer aanvallen. Die heten 'proteasen' want ze knippen eiwitten kapot. Als je die in beeld hebt kan je daar een middel bijzoeken dat hun werking blokkeert.
Kortom genoeg te doen met rekenkracht - maar ik weet niet voor wat voor jobs dat folding@home precies wordt gebruikt.

[Verwijderd]

Maar hoe het eiwit zich opvouwt en wat de structuur is: een grote puzzel.

Dat is nog zachtjes uitgedrukt. Het is ook zelfs nog ingewikkelder. Normalitair zou je dit soort berekeningen baseren op wat thermodynamisch de meest gunstige 3d-configuratie is voor de structuur waarbij je aanneemt dat je ter plekke de verschillende delen in elkaar zet. Dat is rekentechnisch relatief simpel. Voor eiwitten gaat die vlieger niet op doordat de aminozuren allemaal al aan elkaar vast zitten voordat je begint te vouwen. Het is bijna letterlijk origami. Als je in het begin een foutje maakt bij het vouwen dan kun je uiteindelijk nooit meer die mooie zwaan maken die je voor ogen had. Één gevolg hiervan is dat eiwitten eigenlijk nooit thermodynamisch stabiel zijn (laagste energietoestand). Dat maakt het beoordelen van welke 3d-structuur de meest waarschijnlijke is een stuk moeilijker. Een ander gevolg is dat het niet perse zo hoeft te zijn dat een eiwit maar op één manier zal vouwen. Een voorbeeld daarvan zijn de prion ziektes waarbij eiwitten zich abnormaal vouwen en daarmee hun functie verstoord word.

Als je er dan ook nog rekening mee houd dat de meeste eiwitten honderen tot zelfs duizenden aminozuren bevatten en dat in principe elke plek een vouw kan optreden dan zul je realiseren dat het aantal theoretisch mogelijke configuraties al snel absurd groot is. En om het nog lastiger te maken is het geen zeldzaamheid dat een eiwit uit meer dan één aminozuurketen bestaat welke al of niet aan elkaar vastgeknoopt zitten wat het geheel nog ingewikkelder maakt.

Wat het folding@home project doet is tweeledig. Enerzijds kijk je naar hoe je kunt vouwen; niet alle theoretische eindconfiguraties zijn mogelijk om te bereiken doordat bij het vouwen dan dingen moeten gebeuren die niet kunnen (zoals dat 2 delen van ketens door elkaar heen zouden moeten bewegen). Al die configuraties kun je dus schrappen van de lijst van mogelijkheden. Vervolgens ga je alle mogelijke configuraties doorrekenen om te bepalen wat de energietoestand zal zijn. Daaruit kom dan de meest waarschijnlijke configuratie (laagste energieniveau), of een lijst van waarschijnlijke configuraties.

Dan weet je uiteindelijk hoe het eiwit er in 3d uitziet. En dan komt de volgende stap; achterhalen hoe het interactie aangaat met de menselijke cel en de eiwitstructuren die zich daarop en daarin bevinden.

De volgende stap is dan dat je een hele reeks stofjes gaat bedenken die deze interactie kunnen blokkeren en dat je dat proces ook weer gaat simuleren in de computer. Daaruit krijg je dan een lijstje met kandidaten voor geneesmiddelen.

Die lijst ga je dan screenen op mogelijke bijwerkingen. Ik weet niet of dit al fatsoenlijk gesimuleerd kan worden.

[jeffer]

Volgens mij is de rekensom zo lang en ingewikkeld dat de som in stukjes wordt gedeeld en iedereen een stukje berekend. De uitslag daarvan wordt dan weer samen gepuzzeld waardoor het uiteindelijke antwoord tevoorschijn komt.
Als de supercompter dit zelf doet gebeurd dit volgens mij hetzelfde, hij moet alleen die enorme rekensom zelf berekenen.

Som is natuurlijk geen 4x16 achtige omdat het gaat om eiwitten en hoe dit reageert op bepaalde invloeden. Juist omdat er veel factoren meespelen is het zo ingewikkeld.

Ik weet uiteraard de exacte sommen ook niet maar zo is het mij uitgelegd...ik hoop alleen dat ik het goed heb want anders zit ik iedereen wat wijs te maken.

[wica]

Elke vorm van hulp bij het onderzoek naar corona, zodat we sneller een vaccin hebben. Is zeer welkom.
Zolang er geen vaccin is,, zullen we in deze ellende blijven zitten.

[Standeman]

Het vaccin is er waarschijnlijk al. Het moet alleen nog getest worden op veiligheid en werkzaamheid (wat een enorme puist werk is). Als het goed begint Jansen Vaccines in september op mensen te testen. De productie zijn ze alvast gestart.

[Reactie gewijzigd door Standeman op 23 juli 2024 02:21]

[Santford]

Kleine nuance op ‘waarschijnlijk’: Zij hebben uit twaalf experimentele vaccins de meest kansrijke kandidaat gekozen en zijn op eigen risico met productie begonnen.

[Standeman]

Ja. Daarbij ga ik er vanuit dat ze een dergelijk risico niet nemen op een vermoeden of een gok. Dit zal ongetwijfeld zeer sterk onderbouwd zijn. Er wordt een miljard euro in het bedrijf gepompt en ze verwachten 100-300 miljoen vaccins klaar te hebben liggen wanneer de klinische testen voorbij zijn.

Ze zullen geen iene-miene-mutte hebben gedaan

[ToolkiT]

Tuurlijk is het gebaseerd op hun ervaring maar het bedrijfsrisico blijft wel want het kan dat hun release candidate niet door de test komt..

Ik hoop dat ze het goed hebben want anders is er nog meer vertraging op een vaccin..

Ander issue is goede tests want daar is ook nog wel wat twijfel over..

[ejabberd]

Wat ik begrepen heb is dat ze wel degelijk een aantal stappen hebben overgeslagen die ze in andere situaties wel zouden doen. Waar ze in normale omstandigheden nog meer zouden testen om het risico op mislukking verder te reduceren, zijn ze er nu veel sneller voor gegaan.

[dakka]

dit, het duurt alleen minstens 12-14 maanden voor de tests

[jeffer]

Maar waarom folden we dan nog zo hard met zijn alle?

[dakka]

geen idee, F@H doet ook andere ziektes/medicijnen, en je kan niet kiezen of je voor C-19 gaat folden of wat anders, maar goed, de client kan afhankelijk van computergebruik folden, dus als je gaat gamen heb je er geen last van, kan het net zo goed laten draaien.

Maar op het moment rapporteren veel mensen dat er soms gewoon geen opdrachten meer zijn, beetje overcapacity op het moment.

Het is geen compleet nieuw buitenaards virus dat we proberen te doorgronden, anders hadden we het niet in de corona familie gezet, er zijn al veel aanknoop punten om vanuit te gaan bij het ontwikkelen van een vaccin

[Reactie gewijzigd door dakka op 23 juli 2024 02:21]

[Standeman]

Je moet nooit op één paard wedden. En meer data/begrijp over het virus is altijd goed!

[Verwijderd]

Omdat de vaccins die worden getest ook 'maar' vaccins zijn waarvan wordt ingeschat dat ze het meest kansrijk zijn. De tests kunnen volledig mislukken of er kan nieuwe informatie over het virus worden ontdekt waardoor het vaccin kan worden verbeterd of versneld.

[Standeman]

Normaal gesproken wel, maar ik denk dat ze nogal wat "red tape" en bureaucratie willen verminderen / omzeilen aangezien ze in januari de eerste vaccines beschikbaar willen hebben. Maar dat is misschien wel heel erg optimistisch.

[dakka]

grote kans, het is alleen beetje koffiedik kijken hoe het geld zal stromen( maw of ze in de VS geen martin shkreli uithalen)

[Reactie gewijzigd door dakka op 23 juli 2024 02:21]

[jeffer]

Kan niet wachten. Ik heb een 'vitaal' beroep (in ict). Ik wil graag, net als iedereen. Deze gekte zo snel mogelijk achter de rug hebben....maar vooral ook niet ziek worden.

[Coolstart]

Ik heb bewust besmette personen opgezocht in mijn directe omgeving (die koorts hadden + getest) op zo immuniteit op te bouwen. Ik val liever nu uit tijdens de nationale lockdown dan erna. Heb amper ziekteverschijnselen gehad en in die periode niemand anders gezien buiten mijn partner.

Eén van die personen zelf was dokter in een ziekenhuis en kon zo makkelijker ingezet worden in de frontlinie omdat hij natuurlijk ook immuun was. Al had hij dat wel perongeluk opgelopen.

Tegelijk kan ik (we) niet meer perongeluk mijn grootouders besmetten (airbone) (handen wassen noodzaak) en kan ik mijn bubbel vergroten zonder andere ziek te maken.

Ik ga er vanuit dat we tegen volgende winter geen vaccin hebben dus om echt niet ziek te worden ga je toch een jaar thuis moeten blijven vrees ik

[Reactie gewijzigd door Coolstart op 23 juli 2024 02:21]

[jeffer]

Kun je daar wat meer over vertellen of heb je goede linkjes?
Als ik zoek wordt ik overgoten met data die niet is wat ik zoek.
Ik sta voorin de rij als ze in eind van het jaar wat tests hebben gedaan.

[aliencowfarm]

Bij de University of Pittsburgh School of Medicine zijn er ook mee bezig.

Vindt dat ze bij het TU/e het verloop en de voorspelling goed inzichtelijk maken.

[jeffer]

Staat mooie info, vanavond even voor gaan zitten

[aliencowfarm]

Als je het nog breder wil c2w houdt een live blog bij.

[Standeman]

Onder andere

https://www.noordhollands...gint-alvast-met-productie
https://www.vereniginginn...oek-mogelijk-coronavaccin
https://www.nrc.nl/nieuws...ing-coronavaccin-a3995392

[jeffer]

Dank, interessant!

[Santford]

En het persbericht van J&J zelf (Engels):https://www.jnj.com/johns...or-emergency-pandemic-use

[sympa]

Rekenwerk kan ook helpen om een 'gewoon' medicijn te vinden. Zeg maar een pil waardoor de ziekte niet zo heftig verloopt. Dat zou ook een game changer zijn.

[phantom09]

Een tijdje terug waren er mensen in het nieuws dat men tegen vaccins zijn. Dit zou schadelijk zijn voor je gezondheid en dus besloten de ouders om hun kinderen niet te vaccineren.

Ik vraag mij af of deze ouders nog steeds hun kind niet wil laten vacineren tegen corona als er een vaccin is. Of komen ze dan toch met hangende pootjes terug?

[rickboy333]

Als je zelf ook wat PC power wil doneren om het coronavirus te bestrijden kan je Folding@home installeren. Meer info kan je hier vinden.

Misschien leuk om dat toe te voegen aan het artikel?

[Reactie gewijzigd door rickboy333 op 23 juli 2024 02:21]

[The Zep Man]

Als je zelf ook wat PC power wil doneren om het coronavirus te bestrijden kan je Folding@home installeren. Meer info kan je hier vinden.

Folding@home (CPU+GPU) heeft niet altijd work units klaar staan. Al wil je je idle time daarnaast doneren, kijk dan ook naar Rosetta@home (CPU only). Folding@home en Rosetta@home kunnen tegelijkertijd draaien.

[Reactie gewijzigd door The Zep Man op 23 juli 2024 02:21]

[Verwijderd]

Is het op dit moment echt zo dat ze geen werk hebben? Of is het nog steeds hoe het een week geleden was, dat de servers simpelweg niet alle requests in zo'n korte tijd kunnen verwerken?

[ToolkiT]

Ik heb folding@home een uur geleden geinstalleerd en aangezet en heb nog steeds niks in mijn work queue..
Tenzij je iets met de hand aan moet zetten lijkt het er idd op dat er wat vertraging bij vrijgeven van packets is..

[The Zep Man]

Is het op dit moment echt zo dat ze geen werk hebben?

Geen idee. Wat ik schrijf is wat de Folding@home client rapporteert. Daar ga ik niets verder achter zoeken.

[John Stopman]

Rosetta@home is aan mijn BOINC client toegevoegd (SETI stopt er toch mee). Ik heb de University of Amsterdam gejoined: let's beat Covid-19

[Reactie gewijzigd door John Stopman op 23 juli 2024 02:21]

[Martijn.C.V]

Ik meen dat het niet het uitdelen is dat een issue is, maar het terugnemen van het resultaat. Er is een aflevering van Linus Tech Tips die dit melde.

In de advanced interface staat niet dat het wacht op een nieuwe job, maar het staat in queue om de afgeronde weer in de te mogen leveren. Dat je niet een nieuwe job krijgt is dat omdat je je vorige nog niet hebt ingeleverd.

F@H heeft (vorige keer dat ik telde) 250x zoveel FLOPS tot hun beschikking, die zijn heftig aan het opschalen omdat hun hele systeem hier helemaal niet op voorbereid was. Ik weet ook dat bv LTT bezig is om een deel van hun hardware/10gb-verbinding toe te wijden aan helpen van het verwerken van het afgeronde werk.

[Reactie gewijzigd door Martijn.C.V op 23 juli 2024 02:21]

[cracking cloud]

Heeft die inmiddels alweer nieuwe work units beschikbaar? Vorige week stond er niks meer klaar omdat er zoveel mensen meedoen(!)
Gelukkig was er nog wel wat te doen op Rosetta

[lordawesome]

Ze hebben op 1 april assistentie gekregen van de Oracle cloud en op 26 maart hadden ze ook al de server capaciteit weten te verdubbelen.
https://twitter.com/foldingathome/status/1245368664985083906
https://twitter.com/drGregBowman/status/1243405484289228801

Net even geprobeerd. Kreeg direct een Corona GPU WU. Gisteren een CPU WU. Mijn 1080ti staat weer te blazen. 98% Cuda load.

[Reactie gewijzigd door lordawesome op 23 juli 2024 02:21]

[Arator]

Heeft die inmiddels alweer nieuwe work units beschikbaar? Vorige week stond er niks meer klaar omdat er zoveel mensen meedoen(!)
Gelukkig was er nog wel wat te doen op Rosetta

Ik was daarom ook overgeschakeld op Rosetta, maar die staat bij mij nu ook al 2 dagen te wachten op werken.

[bonus]

Gezien de impact die dit virus heeft lijkt me dat niet meer dan logisch. Hoe eerder het is opgelost des de beter.

[Vlizzjeffrey]

Opgelost? Je moet er niet vanuit gaan dat er nu opeens snel een vaccin komt, dat kan nog jaren duren.
Van de vorige 2 gevaarlijke corona virusses, SARS en MERS is nog steeds geen vaccin, en SARS komt uit 2002, denk daar maar is over na.

[Esvel]

Het is ook al toegegeven dat dat gewoon nalatigheid is geweest.

[Division]

Ik neem aan dat u inmiddels ook met GPU en CPU aan het folden bent?
U bent welkom! Dutch Power Cows

[Hengst]

Daar doe ik dus ook met alle beschikbare middelen in mijn huis aan mee maar ik zat net te denken.

Zouden wij als community het voor elkaar kunnen krijgen dat coin miners hun mening stil zetten en hun miningrigs inzetten op de Rosetta en FAH?

Alleen al met ethereum en bitcoin netwerken zou enorm veel GPU power toegevoegd worden. En de waarde van die coins is nu toch relatief laag.

Wie van jullie heeft daar invloed? Wie heeft ideeen?

[arbraxas]

Levert geen cent op en daarvoor staan die coinfarms opgesteld.
Dus die worden eerder uitgezet als voor Rosetta en FAH aangeslingert. Het is simpelweg te duur.
Al helemaal als de inkomsten van coinmining wegvallen in combinatie met het dalen van de waarde van de destreffende coins.

Dus nee, juist door de coronacrisis zullen ze waarschijnlijk uit blijven staan op een enkeling na.

[Reactie gewijzigd door arbraxas op 23 juli 2024 02:21]

[Hengst]

Ik reageerde net al even op @Verwijderd dit ben ik helemaal met je eens, de energie rekening is te hoog en de systemen verouderen supersnel. Wellicht is er een coin nodig die de miners betaalt. Een nieuwe coin waarbij de mining som een Corona research pakketje is zal zelfs oude rigs nog actief kunnen houden. De vraag is dan wie gaat die coin later accepteren om er waarde aan toe te kennen.

Nogmaals, om zoiets te doen heb je ideeen en invloed nodig, mijn vraag staat nog steeds.

[The Zep Man]

Nogmaals, om zoiets te doen heb je ideeen en invloed nodig, mijn vraag staat nog steeds.

Niet alles hoeft om geld te gaan. Mensen die enkel om geld geven hoef je niet te betalen in wat voor tulpen cryptomeuk dan ook. Iedereen die vrijwillig mee wilt doen mag meedoen. Iedereen die dat niet wilt is dat ook niet verplicht.

[Groningerkoek]

Klopt, maar grote miners zijn uiteindelijk ook bedrijven met lopende lasten en die ondanks Corona hun bedrijf gewoon door kunnen laten lopen. Mooi gebaar als zij zoveel geld willen toeleggen om hun rekenkracht beschikbaar te stellen maar kan goed begrijpen als zij denken van laat maar is te duur.

[Reactie gewijzigd door Groningerkoek op 23 juli 2024 02:21]

[bjp]

is zoiets niet GridCoin?

[watercoolertje]

Zouden wij als community het voor elkaar kunnen krijgen dat coin miners hun mening stil zetten en hun miningrigs inzetten op de Rosetta en FAH?

Die kans is net zo groot als jij vrijwillig al je geld weg gaat geven, of je huidige werk op zegt om vrijwilligerswerk te doen...

Tuurlijk heb je er tussen zitten die dat doen, maar verwacht er niet te veel van, geld gaat bij de meeste mensen toch echt voor!

[Hengst]

[...]
Die kans is net zo groot als jij vrijwillig al je geld weg gaat geven, of je huidige werk op zegt om vrijwilligerswerk te doen...

Mijn computers staan nu ook te stampen, ik vraag niemand zijn coins weg te geven ik vraag een miningpauze met als doel corona overwinnen. Lijkt mij prima vrijwilligerswerk. Maar is alleen te rechtvaardigen als hele netwerken mee willen doen.

Tuurlijk heb je er tussen zitten die dat doen, maar verwacht er niet te veel van, geld gaat bij de meeste mensen toch echt voor!

Cash kun je nog verbranden als de economie er aan gaat, crypto levert alleen wat op als we het nog accepteren.

[watercoolertje]

Mijn computers staan nu ook te stampen, ik vraag niemand zijn coins weg te geven ik vraag een miningpauze met als doel corona overwinnen.

Je vraag mensen dus coins (en dus geld) te laten liggen. Daarom mijn vergelijking ook met stoppen met werken of geld weg geven.

Ik zeg trouwens niet dat het een onterechte vraag is alleen dat er weinig gehoor gaan geven, zo werken de meeste mensen gewoon niet!

Cash kun je nog verbranden als de economie er aan gaat, crypto levert alleen wat op als we het nog accepteren.

In de praktijk is het gewoon geld waard.

Punt is dus dat iedereen die daar serieus mee bezig is daar ook (serieus) geld in heeft moeten stoppen, met het idee dat daar iets uit terug gaat komen, je kan dus niet verwachten dat mensen dat doel ineens links laten liggen voor een ander doel wat ze niks in het laatje brengt.

[Reactie gewijzigd door watercoolertje op 23 juli 2024 02:21]

[Martinspire]

Tuulijk kan er veel worden toegevoegd, maar de vraag is dan ook: is er genoeg aanbod voor deze projecten? Uiteindelijk ben je afhankelijk van hoe men met de resultaten omgaat en wat daarna wordt ontwikkeld. Het folden van eiwitten kun je volgens mij vrij makkelijk doen als er genoeg aanbod is, maar dan moeten er wel projecten beschikbaar blijven. En hoe meer data je oplevert, hoe meer je ook weer moet analyseren. Dus meer rekenkracht betekent niet meteen dat er sneller een medicijn is. Uiteindelijk heb je ook mankracht (en kennis) nodig om dat te analyseren.

[Reactie gewijzigd door Martinspire op 23 juli 2024 02:21]

[SgtElPotato]

Waarom? Tenzij er een vergoeding tegenover staat zal geen enkele coinminer hierover nadenken. De maandelijkse kosten zijn namelijk aanzienlijk en die worden niet terug verdient met dit soort acties.

[Division]

Op reddit zag ik in r/homelab al een aantal mining rigs ingezet worden voor covid computing. Het is zo'n dingetje waar je gewoon achter moet staan en niet "kan vragen". Ik heb zelf een bescheiden netwerk dat ik gebruik als render cluster voor Octane, is al lekker 2 weken aan het blazen (letterlijk)

[SgtElPotato]

Hoezo zijn het schurken? Die miningmachines hebben gigantische kosten wekelijks / maandelijks. Aangezien die kosten niet worden vergoed lijkt het me vrij logisch dat het niet gaat gebeuren. Dus omdat ze dat niet opofferen zijn het motherfuckers?

Ik zie geen spannende comments waardoor ik het schurken of motherfuckers zou moeten vinden. Dat jij het niet eens bent dat niemand het doet maken het geen schurken.

[Hengst]

Dank dat je het zo grappig vind maar als ik een mining netwerk / rig had staan zou ik die niet vanwege de kosten niet inzetten maar veel eerder omdat ik dan er op kan rekenen dat mijn rig over een paar maanden na de crisis te langzaam is geworden om nog rendement te hebben. En dat kotm dan doordat alle anderen zijn doorgegaan met minen.

Om een miner zo ver te krijgen zijn energie en systeem in te zetten voor wetenschappelijk onderzoek moet je een heel netwerk overtuigen om mee te doen en allemaal een miningpauze te nemen. Daarna moeten ze dan ook weer gemeenschappelijk overschakelen naar minen op hetzelfde in geplande moment. Dan raakt niemand zijn werk kwijt en wordt ook de investering in de systemen niet te niet gedaan.

Dus ja om zoiets te regelen heb je invloed nodig, invloed op heel veel partijen wereldwijd. En invloed krijgen in een netwerk begint bij een vraag of iemand wil meedoen.

[Initech]

Zojuist gejoined :-)

[01--Rolf--01]

Wanneer komt er nu een app op Android om mee te helpen? Iemand een idee hoeveel FLOPs we daarmee kunnen halen?

[VeerkampR]

Ik heb een tijd Seti@Home via een Boinc client voor Android gedraaid. Productie staat in geen enkele verhouding tov een desktop, en met wat mazzel blaas je de batterij van je telefoon op.

[FrostyPeet]

Stel dat iemand 8 weken moet wachten tot "zijn onderzoek" kan draaien op zo'n supercomputer. Dan zou je er ook voor kunnen kiezen om alvast te starten op een minder sterke computer? Heb je toch al 8 weken gewonnen. Oftewel, waarom niet zelf een handvol pc's aan elkaar knopen en alvast beginnen?

[lordawesome]

PC's aan elkaar knopen is wat Folding@Home doet. Ze hebben nu meer dan een miljoen consumenten cpu's en gpu's aan elkaar geknoopt. En ja dat gaat hard. Sneller dan de top 100 supercomputers samen.

[Reactie gewijzigd door lordawesome op 23 juli 2024 02:21]

[steveman]

Hmm, hoe verhoudt de totale globale rekenkracht dat nu besteed wordt aan corona zich ten opzichte van cryptocurrency?

Hmm, komt bij lange na niet in de buurt. Folding@home zit kennelijk op 10¹⁷ FLOPs.

December 2017 https://cointelegraph.com...matrix-chief-ai-scientist :

8.23x10²² FLOPs gespendeerd aan cryptocurrency mining, van een totale 1.2x10²³ FLOPs

Zou mooi zijn als dat ook ingezet kon worden

[Robbierut4]

Het lastige aan crypto is dat een deel daarvan draait op ASICS, die geweldig veel rekenkracht bieden daarvoor, maar niet inzetbaar zijn voor andere taken zoals F@H.

[Hengst]

Zouden er manieren zijn om ze wel inzetbaar te maken?

[Verwijderd]

Voor zover ik er iets van weet is juist volgens mij het idee van ASICS dat ze heel goed zijn in één taak, maar eigenlijk niet zo nuttig voor andere taken. Het is daarmee dus best lastig om ze iets anders te laten doen, aangezien de hardware daar totaal niet voor gemaakt is.

Maar ik moet eerlijk zeggen dat ik er niet genoeg van weet om dit met zekerheid te zeggen

[WienerBlut]

Je hebt gelijk. Ze kunnen 1x "geprogrammeerd" worden met 1 taak of takenset. FPGA's daarentegen kunnen wel wel opnieuw worden geprogrammeerd (gebeurt bij iedere boot opnieuw). Helaas zijn FPGA's, die ook veel voor crypto coins zijn gebruikt, vaak niet zo snel als ASICs.

[michiel_]

Door de Coronacrisis zijn er heel veel CPU's/GPU's bijgekomen, ze zijn inmiddels de exaflop voorbij:
nieuws: Folding@home bereikt 1 exaflops aan rekenkracht

[RoestVrijStaal]

Er is een shitload aan cryptocoins waarbij geclaimd wordt dat de rekenkracht van de miners gebruikt wordt voor distributed computing.

Helaas blijft dat voor de meesten van die cryptocoins bij claims die niet waargemaakt of waargemaakt kunnen worden. En "het geld" zit nog steeds bij bekendere cryptocoins zoals Bitcoin en Ethereum.

[CH4OS]

Nou ja, de capaciteit is het probleem niet momenteel. Er is dusdanig veel capaciteit, dat er vaak gewoon (in elk geval voor Folding@Home) er regelmatig lege workunit queues zijn.

[steveman]

Bij mij begint het overigens weer voorzichtig te lopen bij zowel Rosetta en Folding

[dakka]

miners gebruiken tegenwoordig ASIC's die zijn goed in een enkel algoritme(scrypt, sha256) dus waardeloos voor folding.

En ik denk niet dat er nog veel grote jongens GPU farms hebben staan aangezien het meer aan stroom kost dan ze te draaien

[Goderic]

Heel weinig, er is niets rekenintensief aan betalingen

[Verwijderd]

Banken hebben zeker servers staan, maar ieder bedrijf heeft servers staan. Maar het lijkt alsof jij vindt dat we banken gewoon even stil moeten leggen? Niemand mag meer geld uitgeven want de banken moeten rekenen?
Met deze logica moet ieder bedrijf met servers gewoon stoppen met werken en meehelpen aan onderzoek. Klinkt leuk, maar dat betekent wel dat deze bedrijven echt stoppen en de mensen die er werken geen werk meer hebben.

Het lijkt alsof je vooral, om een voor mij onduidelijke reden, boos bent op de banken? De mensen bij de bank werken ook nog steeds thuis, en jij pint ook nog steeds je boodschappen bij de supermarkt. Daar is niks aan veranderd, dus het is niet zo alsof de banken de servers even uit kunnen zetten.

[Verwijderd]

Als de banken dicht gaan stopt na een paar dagen een groot deel van de economie. Als cryptocurrency opeens geheel zou verdwijnen zouden alleen malware makers daar direct last van hebben.

En jij snapt werkelijk niets van het verschil in hoeveelheid rekenkracht tussen administratieve processen en het mijnen van coins. Als je dat wel zou doen had je je opmerkingen nooit gemaakt.

[sympa]

Banken hebben die systemen ook staan voor dingen als klantenservice en zo. Het eigenlijke bankwerk: 20 miljoen rekeningen, 20 transacties per dag, 400 miljoen berekeningen. 4630 berekeningen per seconde. Whooo! Dat is de 'kern' van het bankwezen.
Wat er omheen hangt - het inzichtelijk maken op een website (TLS vreet daar het meest aan 'echt rekenwerk denk ik), het beveiligen van pintransacties met crypto, is natuurlijk een veelvoud daarvan.
Maar het valt allemaal in het niet bij cryptocoins.

[Verwijderd]

Alleen cryptomining en 'normaal' bankieren zijn twee totaal andere processen met totaal verschillende ordes van grootte wat betreft servers.

Er is absoluut veel meer rekenkracht beschikbaar binnen het crypto circuit dan voor banken. Want banken verwerken transacties, die hoeven geen euro's te minen met speciale hardware.

[ThaJens]

Dat is niet wat er gezegd wordt. Het betalingsverkeer van banken is niet gebaseerd op mining en dus rekenkracht. Relatief gezien wordt er gigantisch veel rekenkracht "verspild" aan het minen, puur om een crypto systeem in stand te houden. Je kunt er vanuit gaan dat het minen van cryptomunten honderden of misschien wel duizenden keren meer rekenkracht gebruikt dan het hele bankwezen verbruikt voor transacties.

[Goderic]

Nee? Zo'n services hosten kost niet veel cpu kracht en die servers gaan zeker geen gpu's hebben.

Waarschijnlijk hebben ze ook wel wat rekencentra die zouden kunnen helpen, sommige bedrijven doen dat al. Contacteer anders je bank eens om te vragen of ze kunnen helpen? Zou inderdaad wel mooi zijn moesten meer bedrijven meehelpen!

[Mirved]

Heb je uberhaubt naar de link gekeken over wat voor een enorme gebouwen het gaat? of is jouw serverhok 6500m2?

[Mega1958]

Tja, en al die ruimte wordt natuurlijk gebruikt voor compute units. Want een bank hoeft helemaal geen data op te slaan over heel veel jaren. Mijn schatting, 1% computer en de rest andere apparatuur. En dan vergeten we voor het gemak ook maar even het oppervlak waar de mens zich (buiten de corona crisis om) bevindt.

[sympa]

Opslag, gegevensbeveiliging.
Maar goed binnen deze discussie moet je ook aanvoeren hoeveel transacties er dagelijks worden verwerkt door banken versus hoeveel door cryptocoins.
Of andersom: als crypto voor 1 transactie echt merkbaar geld nodig heeft voor compute power dan is dat heel anders dan bij banken. Bij banken gaat het geld zeker niet naar compute power. Wel naar mensen en gebouwen overigens.

[Rabelais]

Vraag van een absolute leek: heeft het altijd zin om de rekenkracht van je CPU/GPU te doneren?
Ik heb alleen een Acer Aspire laptop; Intel Pentium 2117U (1,8 GHz, 2 MB L3 cache) met Intel HD Graphics en 4 GB DDR3.

[lordawesome]

Ik zit nu een WU te doen op mijn GPU die 1,5 uur duurt, maar F@H geeft mij 24 uur 'timeout' en 8 dagen 'expiration'. Dit is op een 1080ti.

[Rabelais]

Dank voor je reactie.

Ik zit nu een WU te doen op mijn GPU die 1,5 uur duurt, maar F@H geeft mij 24 uur 'timeout' en 8 dagen 'expiration'. Dit is op een 1080ti.

... had ik al vermeld dat ik een absolute leek ben...?

[lordawesome]

Nou, je 2117U cpu heeft 3rd gen 1ghz intel hd graphics volgens Intels ark. Die is helaas meer dan 100x langzamer dan een 1080ti: https://gpu.userbenchmark...eron-1011-GHz/3918vsm7695

Dus, als ik er 1,5 uur over doe, doet jouw gpu er 150 uur over. Dat is ruim 6 dagen, wat dichtbij de 8 dagen 'expiration' zit. Ik ben echter bang dat het om de Nbody benchmark gaat wat een physics test is. Dat doet hij 170x langzamer waarmee je op 10,6 dagen zit en de deadline niet haalt.

Ik zou hem maar uit laten staan. Wel goed dat je je afvraagt of het nut heeft.

[Reactie gewijzigd door lordawesome op 23 juli 2024 02:21]

[Rabelais]

Helder, dankjewel voor de uitleg!

[PinusRigida]

Meteen een goeie real-life testcase voor die dingen, exact waarvoor ze o.a. gemaakt werden.

Over die homecomputing zoals BOINC... heb jarenlang SETI draaien gehad op een pc die ik nagenoeg dag en nacht liet aanstaan, bijna exclusief daarvoor, nu heb ik die PC niet meer en op mijn laptop heb ik het ook een tijdje gedaan maar helaas doet het m'n laptop blazen als een F18 op idle, dus ik gebruik het al een hele tijd niet meer op m'n laptop.

Misschien toch nog eens doen met Rosetta en/of Folding, wat meer CPU-demanding dingetjes draaien en de GPU ongemoeid laten. Denk dat het geblaas 'm vooral daaraan lag.

Op de koop toe is de GTX960M gpu nu niet echt om over naar huis te schrijven, maar die i7 ht quadcore HQ leent zich wel perfect voor wat meer cpu-load.

[Alxndr]

Mooi om te zien dat er zoveel rekenkracht beschikbaar is, maar heeft iemand info over een (achtergrond) artikel waarin beschreven/uitgelegd wordt wat voor berekeningen er gedaan worden en hoe/waarom deze relevant zijn?

Het eiwitten-vouwen concept snap ik (een beetje), maar het klinkt alsof er dus ook andere benaderingen/projecten zijn.