Er is een tweede Humble Indie Bundle uitgekomen, met daarin vijf games die op Windows, Linux en OS X draaien. De koper kan zelf de prijs van het spellenpakket bepalen en desgewenst gaat een deel van de opbrengst naar een goed doel.
In de Humble Indie Bundle #2 zijn de titels Braid, Machinarium, Osmos, Cortex Command en Revenge of the Titans te vinden, allemaal gemaakt door onafhankelijke spelontwikkelaars. Opmerkelijk is niet alleen dat de koper van de spellenbundel zelf de prijs kan bepalen, ook kan hij met behulp van sliders aangeven welk deel naar de ontwikkelaars gaat en welk deel naar de goede doelen Child's Play en de Electronic Frontier Foundation.
De games in de tweede spellenbundel zijn net als de eerste Humble Indie Bundle niet van een kopieerbeveiliging voorzien. Op het moment van schrijven waren er meer dan 57.000 bundels verkocht. De gemiddelde prijs die kopers voor het pakket over hebben, schommelt rond de 7 dollar. Opvallend is dat Linux-gebruikers bijna tweemaal zo veel betalen als Windows-gebruikers.