De Klingon komen voor als speelbaar ras in Star Trek Online, maar zijn niet al vanaf het begin van de game speelbaar, volgens producer Craig Zinkievich. Wie een Klingon wil spelen, moet met een Federation-character beginnen.
Volgens Cryptic Studios' Craig Zinkievich wordt Star Trek Online een strijd tussen goed en kwaad, waar de Federation staat voor 'goed' en de Klingon het 'kwaad' vertegenwoordigen. Beide rassen zijn ook speelbaar, volgens Zinkievich, producer van de mmog. De Klingon zijn echter niet direct vanaf het begin van het spel beschikbaar. Wie als Klingon wil spelen, moet eerst met een Federation-character een bepaald niveau halen. Pas daarna kan voor een Klingon gekozen worden. Bovendien is de speelstijl van een Klingon-character anders dan van een Federation-character, volgens Zinkievich, al gaat hij in het interview dat hij aan EuroGamer gaf niet in op de verschillen. Hij liet wel los dat de Klingon meer gericht zijn op player versus player-gevechten, terwijl de Federation-characters meer verhaal voorgeschoteld krijgen. Klingon zijn echter wel volwaardige characters, die in niveau kunnen stijgen en nieuwe mogelijkheden en uitrusting kunnen bemachtigen.
Naar verwachting wordt Star Trek Online begin 2010 gelanceerd, al moet de bètatest van het spel nog beginnen. Het verschijnt alleen voor de pc. Het idee om mmog's op een console uit te brengen, lijkt Cryptic losgelaten te hebben. Daar was sprake van bij zowel STO als Champions Online, de mmog die Cryptic eind september op de markt bracht. De ontwikkeling van Star Trek Online begon bij ontwikkelaar Perpetual Entertainment, dat van 2004 tot 2008 aan het spel werkte. Cryptic maakte halverwege 2008 bekend dat het de ontwikkeling van Star Trek Online overnam, en liet toen weten dat de mmog voor zowel de pc als de Xbox 360 zou verschijnen.