Met de lancering van versie 3.0 van de Firefox-browser in 2007 zal Mozilla ondersteuning voor Windows 98 en Windows Me laten vallen. Dit is het rechtstreekse gevolg van het niet langer ondersteunen van deze besturingssystemen in Gecko 1.9, de renderengine die gebruikt zal worden in de toekomstige Firefox-uitgave. Het afschaffen van de ondersteuning is een gevolg van de ingebruikname van een aantal nieuwe programmaonderdelen. De actie stuitte op heel wat weerstand van gebruikers, die de organisatie opriepen om de nieuwe software niet klakkeloos in te voeren. Een uitgebreid onderzoek naar gebruikte besturingssystemen bij de installatie van een nieuwe browserversie zou volgens hen duidelijkheid kunnen scheppen over de te nemen acties met betrekking tot OS-ondersteuning.
Daartegenover staat dan weer dat Mozilla-ontwikkelaar Gervase Markham zelfs oproept om ondersteuning voor de verouderde besturingssystemen zelfs nog eerder te laten vallen, als het aan hem ligt met de lancering van Firefox 2.0 in augustus. Hij argumenteert dat Microsoft na 11 juli geen veiligheidspatches meer zal leveren en dat het daarom onverantwoord zou zijn Firefox nog langer op deze systemen te ondersteunen. 'Het geeft gebruikers onterecht het gevoel dat ze nog veilig kunnen browsen met deze besturingssystemen, als ze een ondersteunde Firefox kunnen gebruiken', aldus Markham.