Linux-ontwikkelaars maken zich ongerust over de oem-eisen die Microsoft wellicht zal opleggen aan computerfabrikanten die Windows 8-certified-pc's gaan leveren. De vrees bestaat dat het beveiligde bootproces het booten van Linux verhindert.
Een toenemend aantal pc's en laptops wordt uitgerust met een unified extensible firmware interface als vervanger voor het verouderde bios. Hierdoor wordt het startproces versneld en is er ondersteuning voor harde schijven die van een guid-partitietabel zijn voorzien. Uefi's maken het ook mogelijk om het bootproces te beveiligen.
Microsoft wil de beveiligingsoptie benutten door het hele bootproces van Windows 8 af te sluiten. De uefi zou uitsluitend code mogen accepteren als die is voorzien van een geldige handtekening die door een Certificate Authority is uitgegeven. Hierdoor moet worden voorkomen dat malware zich in het besturingssysteem weet te nestelen en bij het starten van Windows 8 actief wordt.
Microsoft wil de implementatie van de secure boot-methode afdwingen door in het Windows Logo-programma te eisen dat computerfabrikanten de beveiligde startmodus standaard activeren in de uefi. Linux-ontwikkelaars maken zich echter zorgen, omdat nog niet duidelijk is of de secure boot-optie in de uefi kan worden uitgeschakeld. Als de softwaregigant dit in zijn Windows Logo-programma verbiedt, wordt het op dergelijke systemen onmogelijk om alternatieve besturingssystemen zoals Linux te starten, omdat deze niet van de gewenste handtekening zijn voorzien. Als de fabrikant het wel mogelijk maakt om de secure boot-optie in de uefi uit te schakelen, is het ook denkbaar dat Windows 8 weigert te booten totdat het beveiligde bootproces weer wordt geactiveerd.
Microsoft heeft nog geen helderheid gegeven over de definitieve voorwaarden van het Windows Logo-programma, terwijl ook de houding van computerfabrikanten ongewis blijft. Blogger Brian Proffitt suggereert echter op zijn blog dat het uitsluiten van andere besturingssystemenen zoals Linux voor Microsoft een aardige bijkomstigheid is. De mogelijkheid om Linux te voorzien van handtekeningen van CA-autoriteiten wordt niet als oplossing gezien. Dit zou in strijd zijn met de gpl-voorwaarden en het bovendien voor Linux-gebruikers die hun eigen kernel compileren vrijwel onmogelijk maken om aan een correcte handtekening te komen.