Op het forum van Apple klagen veel bezitters van een MacBook Retina over de ventilators in de laptop, die plotseling harder kunnen gaan draaien zonder tempatuurstijging. Het probleem lijkt alleen voor te komen bij de nieuwste generatie van de laptops, die van 2013.
Gebruikers melden dat de ventilatorsnelheid van de MacBook Retina's in sommige gevallen oploopt tot 6000 toeren per minuut. Die snelheid wordt dan ongeveer een minuut aangehouden, waarna hij weer daalt. Het probleem doet zich voor terwijl er nauwelijks cpu-activiteit is en er geen temperatuurstijging plaatsvindt. Het ventilatorprobleem lijkt structureel te zijn; een gebruiker heeft er na een herinstallatie, een vervanging van het moederbord, en zelfs een vervanging van de laptop, nog steeds last van. Zowel 13"- als 15"-MacBooks zijn getroffen door het probleem.
De MacBook Retina's werden in februari nog van een update voorzien, daarbij verlaagde Apple de prijzen van de laptops ook enigszins. Er zou toen ook van ssd-leverancier gewisseld zijn. De nieuwe MacBook Retina's beschikken over ssd's van Sandisk, terwijl het 2012-model Samsung-ssd's bevatte. Gebruikers op het Apple-forum vermoeden dat de nieuwe ssd de pieken in de ventilatorsnelheid veroorzaakt. Het probleem zou optreden bij veel schijfactiviteit. Enkele gebruikers hebben de ssd in hun laptop vervangen door een ander exemplaar, waarmee het probleem opgelost lijkt te zijn.
De spaarzame reacties die Apple volgens gebruikers in het forumtopic heeft gegeven, variëren. Er zou gezegd zijn dat het probleem in de 10.8.3-update van OS X wordt opgelost, maar een andere medewerker van Apple zou gezegd hebben dat het pieken van de ventilatorsnelheid een ontwerpkeuze is die samenhangt met het kleine formaat van de laptops.