Onenigheid tussen de beheerders van Freedb heeft ertoe geleid dat de stekker uit het project wordt getrokken. De database met gegevens over muziekdragers, die opgezet werd om een open-sourcealternatief voor het commerciële CDDB van Gracenote te bieden, zal 'in de nabije toekomst' worden stopgezet. De kern van het conflict is de ontwikkeling van nieuwe software door de Australiër Andrew Smith, die ruim een jaar aan nieuwe software voor het project werkte. Volgens Freedb-oprichter Michael Kaiser was het werk van Smith een bedreiging voor het open-sourcekarakter van Freedb. Drijvende krachten Jörg Schilling en Ari Sundholm, die het ingrijpen van Kaiser als eigenmachtig betitelen, zegden daarop hun vertrouwen in hem op en staakten hun medewerking aan het project. Schilling noemt het 'verschrikkelijk dat wat Gracenote zeven jaar lang probeerde te bereiken, door dit probleem in een paar weken werkelijkheid is geworden.' In zijn laatste post op Freedb.org stelt Kaiser dat hij 'ziek van de hele zaak is' en omdat hij niet zonder Schilling en Sundholm verder wil, biedt hij het domein te koop aan.
Smith heeft ondertussen freedb2.org online gebracht, maar die site lijkt nog amper bruikbaar te zijn. De database van Freedb, waar in de afgelopen jaren zo'n twee miljoen entries aan zijn toegevoegd, is nog wel publiekelijk beschikbaar, net als de 'oude' software. Kaiser zegt te hopen dat een andere partij de erfenis van Freedb overneemt op een manier die 'beter' is en ervoor zorgt dat zowel de data als de gebruikte software vrij beschikbaar blijft. Onder meer omdat Freedb's protocol compatibel is met de eerste CDDB-interface, zijn er honderden applicaties die van deze online resource gebruik kunnen maken. Gracenote, dat in 2001 ongelicenseerd gebruik van zijn database verbood, heeft door middel van het CDDB2-protocol al eerder een technische barrière tegen het gebruik van dit protocol opgeworpen, zodat veel afspeel- en ripsoftware met het verdwijnen van Freedb een belangrijk deel van hun functionaliteit kwijtraakt. Of Freedb op een of andere manier een doorstart beleeft, of dat andere diensten zoals MusicBrainz of het commerciële AMG Lasso de achtergelaten leemte zullen opvullen, valt nog te bezien.