Nintendo voorziet zijn versie van Guitar Hero 3 voor de Wii van enkele unieke functies die concurrenten Sony en Microsoft niet kunnen bieden met hun Playstation 3 en Xbox 360. De Wii-controller kan namelijk in de gitaar worden geklikt.
Door bij Guitar Hero 3 de Wiimote in de gitaar op te bergen, kan het muziekinstrument trillen en geluid maken. Zodra een gebruiker bijvoorbeeld een verkeerde noot aanslaat, is dit via de Wii-controller te horen. Bij meerdere spelers wordt middels afzonderlijke geluiden bovendien ten gehore gebracht wie de fout maakte.
De Wii-versie van het spel tovert 60 frames per seconde op het scherm in breedbeeld en met een resolutie van 480p. Met de multiplayerfunctie is het mogelijk om een nummer samen te spelen, maar ook competitie is mogelijk. Daarnaast kan er via internet gespeeld worden. Guitar Hero 3 komt 28 oktober in de winkel te liggen. Het gerucht gaat dat de Wii-versie de goedkoopste zal zijn, iets dat goed te verklaren is.

De rumblefunctie zal de gitaar laten trillen als er iets speciaals gebeurt in de game. Spelers kunnen hun gitaar bovendien nog steeds met de hals schuin omhooghouden om in bepaalde stukken meer punten te verkrijgen, maar de bewegingsdetectie wordt nu verzorgd door de Wii-controller en niet langer door een ingebouwde tiltsensor. De Xbox 360- en Playstation 3-editie beschikken wel nog over het ingebouwde stukje elektronica, waardoor deze mogelijk duurder zullen uitvallen.
De gitaren zullen voor alle consoles in een draadloze variant verkrijgbaar zijn. De nek van de gitaar kan gedemonteerd worden en ook het frontje is verwijderbaar. Een analoge stick op de Wii-gitaar zal de speler laten navigeren door de Wii-menu's. Guitar Hero 3 zal meer dan 70 liedjes bevatten, waaronder nummers van Metallica, Guns 'n Roses en Beastie Boys.