Door FireStar Software is een rechtszaak aangespannen tegen Red Hat omdat laatstgenoemde met Hibernate 3.0 van het recent overgenomen JBoss inbreuk zou maken op een patent van de klagende partij. Het bewuste patent behelst een methode om relationele databases te koppelen aan objectgeoriënteerde software. Hibernate is een object-relational mapping tool en vormt een onderdeel van het JBoss Enterprise Middleware System. FireStar wil via de rechter bereiken dat een schadevergoeding betaald wordt en dat gestopt wordt met de verspreiding van Hibernate. Red Hat heeft aangegeven dat er aan de zaak gewerkt wordt en dat deze via de juiste juridische weg zal worden opgelost.
Analisten vragen zich af waarom FireStar achter Red Hat en JBoss aangaat en niet achter een andere speler, zoals Oracle of Sun. Die bedrijven bieden namelijk ook software aan die inbreuk maakt op het eerder genoemde patent en er is meer geld te halen. Ondanks dat de rechtszaak primair gericht is op Red Hat, bestaat de mogelijkheid dat andere bedrijven op de achtergrond juridische steun aan het softwarebedrijf gaan verlenen. De rechtszaak is aangespannen in Texas, bij een rechtbank die bekend staat om zijn snelle afhandeling van patentzaken. Een eventuele veroordeling en langdurige juridische strijd zouden Red Hat veel geld gaan kosten.