Gedistribueerd zoeken naar miltvuurmedicijn

In navolging van de welbekende RC5 decryptie-race, de SETI@Home zoektocht naar buitenaards leven en het initiatief van Intel om met hulp van gewone computers te zoeken naar een kuur voor leukemie, is er nu een nieuw gedistribueerd project waar je je overbodige computercycles aan kan doneren: de zoektocht naar een medicijn voor miltvuur.

Onderzoekers van de Universiteit van Oxford hebben in samenwerking met Intel en Microsoft een screensaver ontwikkeld die gedistribueerd 3.5 miljard moleculen gaat onderzoeken op reacties met het anthrax virus:

The initiative is modeled on the Intel-United Devices Cancer Research Project, which utilized the computing power of 1.3 million personal computers around the world to provide scientists access to a virtual supercomputer more powerful than the world's 10 largest supercomputers combined, the group said.

The anthrax project will draw upon the same distributed computing technology to help scientists screen 3.5 billion molecular compounds against the fatal anthrax toxin protein.

Lees verder bij CNN, Reuters of bij

Ananova. Op de site van Intel kan je vanaf nu dus meedoen met drie filantropische projecten: zoeken naar een behandelmethode voor leukemie, een medicijn voor alzheimer of een kuur voor miltvuur.

Reacties (51)

[Beaves]

Op de site van Intel kan je vanaf nu dus meedoen met drie filantropische projecten: zoeken naar een behandelmethode voor leukemie, een medicijn voor alzheimer of een kuur voor miltvuur.

Dan vind ik de zoektocht naar oplossingen voor leukemie en alzheimer toch veel en veel nuttiger dan de zoektocht naar de kuur voor miltvuur. Miltvuur is IMHO geen echte bedrijging, de enige die dat wel vinden zijn de Amerikanen, door de gebeurtenissen de afgelopen tijd in de VS.

En ook al zouden we een kuur vinden tegen miltvuur, de mensen die kwaad willen gaan dan toch wel over op andere biologische wapens. Dan blijven we met zijn allen bezig.

[Verwijderd]

Je blijft sowieso zoeken... er bestaan altijd wel weer andere moleculen waarvan we nu het bestaan nog niet kunnen vermoeden.

Maar afgezien daarvan; je kunt met een berekening geen medicijn vinden. Men wil een beperkt aantal stoffen vinden die mogelijk op een bepaalde wijze interactie aangaan met het toxine eiwit en als medicijn zouden kunnen dienen. Deze potentiële medicijnen (en dat zullen er waarschijnlijk nog duizenden of tienduizenden zijn) zullen dan getest moeten worden op hun werkelijke activiteit. En uiteraard moet ook nog uitgezocht worden of deze 'medicijnen' zelf niet toxisch zijn.

Dus dat hele rekending is niet meer dan enige (nou ja... best wel een grote enige) tijdsbesparing die dus het moeilijke screenen op gewenste activiteit van een heleboel niet actieve stoffen onnodig maakt, zodat we ons direct kunnen richten op meerbelovende moleculen.

[Qwerty-273]

Dan vind ik de zoektocht naar oplossingen voor leukemie en alzheimer toch veel en veel nuttiger dan de zoektocht naar de kuur voor miltvuur. Miltvuur is IMHO geen echte bedrijging, de enige die dat wel vinden zijn de Amerikanen, door de gebeurtenissen de afgelopen tijd in de VS.

Miltvuur komt nog steeds gewoon natuurlijk voo rhoor, bv. in de oude sovjet unie sterven er zo per jaar ongeveer 35-40 mensen aan miltvuur. Trouwens beter dat je een kuur er tegen hebt dan dat je die niet hebt. Stel dat het toch uitbreekt liever al wat onderzoek er naar dan datje nog 15 jaar moet wachten tot ze er iets van snappen.

De ziektes waarmee veel geld te verdienen valt worden onderzocht door veel commerciele geneeskundige fabrieken. Neem bv malaria, daar wordt goud geld aanverdient. Het onderzoek was destijds nog gesponsord door de amerikaanse overheid omdat amerikaanse troepen naar een gebied moesten waar malaria voor komt. Dus 1 een lage investering door het bedrijf zelf en 2 veel opbrengsten.

[Stefan©]

raakt dit soort distributie nu niet verzadigt? want hoeveel van dit soort distributies zijn er nu wel niet?

[Randal Peelen]

Hoe meer projecten er zijn hoe kleiner de kans dat er veel mensen aan meedoen, aan de andere kant kun je ook een paar van je % CPU cycles (mits ongebruikt uiteraard) aan andere projecten dan je huidige besteden. Je hebt dan op elk project relatief lage stat's maar je doet wel een hele boel tegelijk, ook kun je beslissen toch maar wat nuttig werk te gaan doen, want laten we eerlijk zijn ( ), massaal zoeken naar een 64 bits sleutel is natuurlijk puur overbodig (behalve voor de stat's). Dan kun je in princiepe beter naar medicijnen zoeken.

[Cozm0]

/kwoot: massaal zoeken naar een 64 bits sleutel is natuurlijk puur overbodig (behalve voor de stat's). Dan kun je in principe beter naar medicijnen zoeken. /unkwoot jimmy pop

hier ben ik het volledig mee eens, ik vind een bijdrage doen aan het onderzoek naar kanker, leukemie, alzheimer of miltvuur echt veel belangrijker dan het kraken van een 64 bits sleutel

Tenslotte gaat het hier om ziektes waar echte mensen aan lijden.
Ik zou graag zien dat de mensen van tweakers.net daar hun spare cpu time zouden besteden ipv iets virtueels als het kraken van een 64 bits key
*tot zover paus Cozm0*

[TheGhostInc]

Theoretisch zou het zelfs sneller kunnen gaan als je meerdere distributed clients draait, zeker als dadelijk processoren van Intel Hyper Threading Technology gaan gebruiken zou het een stuk sneller kunnen.
Ook als een bepaald proces niet de complete CPU gebruikt zouden andere processen tegelijkertijd andere delen kunnen gebruiken.

[CmdrKeen]

Wel leuk dat ik kan kiezen waaraan ik mijn cycles doneer!

[crisp]

Bij deze wil ik alle mensen die dit lezen en er aan denken om mee te gaan doen met dit of een ander DC project wijzen op het DPC-forum van GoT.
Korte uitleg: DPC staat voor Dutch Power Cows, en is een team dat zich al geruime tijd bezig houdt met verschillende DC (Distributed Computing) projecten onder het mom van: eendracht maakt macht.
Als bewijs staan we 1e in zowel de RC5 contest als de OGR contest van Distributed.net.

[Verwijderd]

- fatal anthrax toxin protein -

Mag ik er even op wijzen dat van een medicijn dus geen sprake is?

Dit is een tegengif.

Een middel dat het toxine neutraliseert is wat anders dan een middel dat de miltvuurbacterie doodt.

Van miltvuur ga je dood omdat de miltvuurbacterie een toxine afscheid en dat heeft zijn nadelige effecten op je lichaam.
Wat ze nu zoeken is een middel dat het toxine onschadelijk maakt.
Maar ondertussen blijven die bacterieen wel gewoon in je lichaam en gaan ze lekker door dat toxine te produceren.

Het is zeer goed mogelijk dat met dit spul mensen gered kunnen worden die door de toxische werking te zwak zijn geworden om tegen de bacterie te vechten.
Maar uiteindelijk zijn het antibiotica (die de kleine ettertjes direct aanvallen) en toch vooral het menselijke imuunsysteem die het echte werk moeten opknappen.

Nog een punt:
Afgelopen jaren zijn er vele malen meer mensen doodgegaan door blikseminslag dan door miltvuur.
Het is nou niet bepaald doodsoorzaak no. 1 of zo.
Hier je cputijd aan besteden is zinloos, en niet veel meer dan een modegril, onder het motto 'Vecht nu ook tegen de terroristen !'.
Speel dan Counterstrike of Rainbow six of zo als je iets leukers wil, en gebruik dingen als folding@home en seti als je wat idealistischer ingesteld bent..

Ikzelf blijf gewoon lekker naar groene mannetjes zoeken....
;^)

[Rannasha]

Heeft een van de vele DC-projecten nu eigenlijk al iets zinnigs opgeleverd??

[intoxicated]

Tot op zekere zin wel. RC5 is natuurlijk niet echt nuttig, maar dingen als OGR zouden een praktisch nut kunnen hebben. Maar distributed computing is ook in bedrijfsomgevingen handig, zo hoeven bedrijven niet te investeren in dedicated 'supercomputers', maar kunnen de normale systemen, die toch niets staan te doen, ingezet worden. Dus ja, distributed computing heeft echt nut.

Overigens zijn er nog meer distributed projecten (Genome @ home , kankeronderzoek etc.) die ook nuttige data opleveren voor onderzoeken.

[Verwijderd]

Wat ik me altijd afvraag of dat zoeken naar moleculen die een medicijn zouden kunnnen zijn nou werkelijk wat oplevert, het zou me namelijk niet verbazen als de kans dat je echt een middel vindt maar zeer minimaal is (ook al onderzoek je alle 3 miljard moleculen) en dat het vooral een PR-stunt van Microsoft en Intel is...

[Verwijderd]

ach ja... kans van 1 op een miljard versus kans van 1 op een paar quadriljard... het is maar waar je het mee vergelijkt.

Aan de lotto doen toch ook nog steeds mensen mee e ?

Aangaande de PR... ja, natuurlijk is het deels of geheel PR. En wat dan nog ? Welk bedrijf doet dat nou niet ?

Nuon sponsorde die solar race jongens in Australië ook niet voor de gein.

[Verwijderd]

beetje nutteloos denk je niet ?
Anthrax is helemaal nie zo gevaarlijk als beweerd wordt. Enkel met direct contact heb je wat kans om dood te vallen.
Men zou beter een deftig project runnen om bv AIDS te onderzoeken

[Bestiole]

Yep helemaal mee eens, het wordt tijd dat ze zoiets opzetten om iets tegen het HIV virus te vinden...

Ach het komt waarschijnlijk wel in de komende maanden..

[Verwijderd]

Grappig dat je bij commerciele bedrijven als UD, die gesteund worden door andere grotere commerciele organisaties, nooit echt helemaal weet waar je computer op staat te rekenen. Wellicht op een ander soort miltvuur, ipv een medicijn. Het kankeronderzoek van UD is niet commercieel, tenzij je de resultaten zou willen hebben. Zo kun je het ook draaien, en dat doet UD slim. De redenen waarom dit soort projecten niet voor zinnigere ziektes zoals AIDS gedaan wordt liggen vaak financieel. Zolang er onderzoek gedaan wordt is er geld nodig, veel geld, en dan kun je ook nog wat andere onderzoekjes doen en af en toe claimen dat je (niet)onderzoek naar AIDS niets heeft opgeleverd, maar dat er meer geld nodig is..

[Roland684]

Kankeronderzoek is voor UD voornamelijk een publiciteitstrekker. Ze doen ook nog een aantal (lang niet zo ideologische) projecten waar je geen mensen mee binnenhaalt.

[The Source]

OK... wie zegt mij dat het project ook echt gebruikt wordt waarvoor ze zeggen dat het dient?

Leuke screensaver met wat moculen waar een miltvuur virus op losgelaten wordt. Maar misschien zit er wel een organisatie achter die er nucluaire kern proeven mee doet? Tja... als je zo'n klein pakketje berekent dan kun je natuurlijk nooit checken of de inhoud klopt...

[Verwijderd]

<sarcasme>En wie zegt mij dat jij niet een of anderere terrorist bent die het niet zo fijn zou vinden als je hele voorraad Anthrax straks misschien niet zo veel meer uithaalt ?</sarcasme>

[Verwijderd]

In theorie is er al een "cure":
http://www.krysalis.net/anthrax.htm

[Verwijderd]

Zijn theorie is wel leuk, maar vergeet vooral z'n conclusie niet...

Zijn behandeling is alleen echt effectief in combinatie met een aggressieve antibioticum kuur.
En laat dat nou net een van de dingen zijn waar medici wereldwijd vanaf willen - want je hebt een verhoogde kans op het creëeren van immune varianten van de Anthrax bacterie, en wie weet wat voor ander spul jij misschien in je lichaam hebt.