Nieuwe DNA-chip kan griepvirussen herkennen

Onderzoekers aan de universiteit van Colorado hebben een chip ontwikkeld die binnen een halve dag uitsluitsel moet geven over een eventuele griepbesmetting bij een patiënt. De chip kon in een aantal tests met een zekerheid van 90 procent aantonen om welk type griep het ging. Snellere methodes kunnen slechts aangeven dat er sprake is van griep, terwijl methodes die griepvarianten onderscheiden pas na enkele dagen resultaat geven. De onderzoekers hebben inmiddels twee jaar gewerkt aan de chip en verwachten dat deze volgend jaar al in een groot aantal laboratoria gebruikt zal worden. Het detecteren van de vogelgriepvariant H5N1, die momenteel in delen van Azië en Europa wordt geconstateerd, en mutaties van dat virus behoort tot de mogelijkheden.

De chip maakt gebruik van een zogenoemde DNA-microarray, een verzameling microscopische stippen die samen voor griepsoorten specifieke DNA-fragmenten bevatten. Een RNA-preparaat van een mogelijk geïnfecteerd persoon wordt vervolgens in contact gebracht met de chip, waarna de RNA-fragmenten zich binden aan bepaalde genen op de chip. Met een fluoriserende hulpstof en een laserscanner wordt vervolgens het resultaat geanalyseerd. De bedoeling is om de komende jaren te werken aan handheld-apparaten waarmee de tests kunnen worden uitgevoerd. De benodigde tijd zou nog kunnen worden teruggebracht met enkele uren. Met enkele aanpassingen is de chip ook geschikt te maken voor andere RNA-virussen als HIV en SARS.

Reacties (27)

[DaRealRenzel]

En dan blijkt dat de chip 12 euro per stuk kost vanwege patent en licentie kosten (werkelijke kosten 1 eurocent, maar ja, fabrikant heeft ook aandeelhouders) dus is alleen de rijke westerse wereld weer gered van een pandemie

[veldsla]

Helaas, met 12 euro aan productiekosten ga je het niet redden. 1 glaasje kost al meer dan 300 euro. Dit kan in massa naar 1/8 als je met minder genen je test kan maken en dus meerdere arrays op 1 glaasje kan printen.

En dan zijn er inderdaad ook nog patentkosten, er is nl een bedrijf dat de hoge dichtheid microarray techniek gepatenteerd heeft.

Verder heeft deze techniek weinig met computerchips te maken, ze zijn ooit DNA chip gedoopt omdat de dichtheid zo hoog is dat het op een chip lijkt.

Een voorbeeld van een diagnostische microarraytest is MamaPrint ( http://www.agendia.com ), waarmee gekeken wordt of een borsttumor een goed danwel slecht overlevingsprofiel heeft.

[Anoniem: 140475]

De onderzoekers hebben inmiddels twee jaar gewerkt aan de chip en verwachten dat deze volgend jaar al in een groot aantal laboratoria gebruikt zal worden.

Research kost nu eenmaal geld en het is in onze maatschappij nu eenmaal gebruikelijk dat een bedrijf geld probeert te verdienen. Het verdiende geld wordt gedeeltelijk weer geïnvesteerd in nieuwe technologieen waar wij allen en onze kinderen uiteindelijk van profiteren.

Met enkele aanpassingen is de chip ook geschikt te maken voor andere RNA-virussen als HIV en SARS.

Hoeveel geld wordt direct bespaard doordat deze technologie het aantal besmettingen van bovengenoemde ziektes wordt teruggebracht, het behandelen van een ziekte kost aan medicinatie en opnames in een ziekenhuis een veelvoud dan de kosten van de chip.

Dit soort vooruitgang komt zeker niet alleen ten goede aan de westerse maatschappij maar aan de totale wereldbevolking.

[Verwijderd]

Gelukkig is het onderzoek wat het bedrijf doet om de chip te maken ook gratis, en lukt het altijd om een nieuw medicijn te maken

[Ramzzz]

offtopic:
En wat als de virusherkennende computer zelf wordt geveld door een virus...

Zonder dollen, dit is natuurlijke een prachtige ontwikkeling. Ziekten analyseren in een snelle stap door een 'onfeilbare' (?) machine.

Leuk dat de SF-literatuur (Asimov, etc) het toch elke keer weer bij het rechte eind blijkt te hebben voor waar het technologische ontwikkelingen betreft. Misschien niet exact op de datum nauwkeurig, maar uiteindelijk zitten ze wel op het juiste spoor! De Star Trek-achtige apparaatjes liggen dus echt in 't verschiet!

[Luuk1983]

Damn it Jim! I'm a doctor, not a microchip!

[Pmf1971]

Daar dacht ik nou net ook aan toen startrek genoemd werd...fascinating!

[anandus]

Meer info over DNA-micro-arrays: Wikipedia

Moet het griepvirus-RNA niet eerst gePCRd worden, dan? Lijkt mij moeilijk om er een handheld-versie van te maken dan?

offtopic:
Overigens zijn DNA-microarrays imho een van de grootste uitvindingen van de afgelopen tijd, je kan in no-time zien of iets of iemand bepaalde genen wel of niet heeft, zeker in de diagnostiek, zoals hier, is het een gigantische uitvinding, al is het ook geweldig voor biologisch/medisch onderzoek (denk aan het vergelijken van genen tussen verschillende cellen of organismen)

[Raafz0r]

En het is dus geen computerchip zoals in de titel wordt beweerd. Het gaat hier gewoon om een lab-on-a-chip ipv een IC.

[anandus]

Het is inderdaad geen IC en voert geen berekeningen uit, maar het geeft wel een bepaalde output bij een bepaalde input.

Overigens vind ik computerchip ook niet echt een goede woordkeuze, en zou ik het ook eerder een lab-on-a-chip (ofzo) noemen (of gewoon het beestje bij z'n naam noemen: een DNA-Microarray Chip)

[Anoniem: 115364]

De bedoeling is om de komende jaren te werken aan handheld-apparaten waarmee de tests kunnen worden uitgevoerd.

de stap naar de beroemde tricorder uit startrek.

[peltus]

'De griep' is inderdaad ook wel op andere manieren vast te stellen maar als je met zekerheid wilt weten of het bijvoorbeeld om een H5N1 variant gaat, of erger nog; een mutant die van mens op mens kan worden overgedragen, moet je toch echt 'even' een DNA testje doen.

[Anoniem: 63400]

Leuk als je baas dit in handen krijgt.
Sorry baas kan vandaag niet komen.
Mooi mannetje kom jij maar eerst langs kantoor.

Nou daar ga je dan met je kater van de vorige avond.

[Verwijderd]

Hmmm, best wel een interesante gedachtengang. Nu zeggen mensen toch redelijk snel dat ze niet naar huis toe willen omdat ze waarschijnlijk griep hebben.

Met dit apparaatje zal het niet gebeuren, maar als er in de toekomst een goedkopere, handzamere commerciele variant van komt dan zie ik het inderdaad nog wel gebeuren dat een bedrijf even wil controleren of het echt zo is voordat de werknemer verlof krijgt om eerder naar huis te gaan.

Ook op scholen zal dit zo wel z'n toepassing hebben.

Aan de andere kant zijn er natuurlijk weer 1001 andere redenen dat iemand zich niet lekker voelt terwijl het geen griep is.

[Anoniem: 84698]

yessss, Pino is hierdoor een stuk veiliger

[Qorne]

Zit er ook een Live update functie in

[domaincontrol]

Een variant van de DNA-Microarray is de GeneChip(R) Arrays van Affymetrix. Op deze array worden DNA oligo's aangebracht met behulp van LCDfoto-lithografische maskers, net als bij processoren ('echte chips'). Dit verklaart wellicht de verwaring over de term chips.

De nieuwswaarde van dit bericht zit hem in het feit dat het nu mogelijk is een griep test te doen. Andere testen zoals voor bepaalde type kanker bestaan reeds. Ook zijn er al handzamere microarray apparaten op de markt zoals van het nederlandse bedrijf Pamgene.