Distributed computing project D2OL bestrijdt SARS

Verschillende nieuwssites weten te melden dat Distributed computing-projectorganisator Sengent op de angst voor SARS is ingesprongen door de zoektocht naar een vaccin of medicijn voor deze ziekte op te nemen in zijn D2OL-project. Hier staat D2OL voor Drug Design en Optimization Lab, dit project heeft tot doel om via het gedistribueerd verwerken van kleine stukjes data uiteindelijk een mogelijke middel tegen ziektes zoals SARS, Ebola en Botulisme te vinden. Met het stapsgewijs aflopen van eiwitstructuren hoopt men dit te doen. Hierbij wordt alleen rekenkracht gebruikt die op dat moment niet door andere programma's vereist is.

Eerder kreeg het D2OL-project al een sterke duw in de rug door het toendertijd door Amerikanen gevreesde Miltvuur aan zijn lijst van te bestrijden ziektes toe te voegen. Ook de Dutch Power Cows, afkomstig van ons forum, heeft een D2OL-afdeling. Momenteel staat dit team tweede in de ranglijst. Meer informatie is in de FAQ terug te vinden. De nieuwste variant van de drie bekende Coronavirussen verschilt ruwweg de helft van zijn voorgangers. Met het actief bestrijden van een van de Coronavirussen hoopt men de anderen ook te kunnen genezen.

Reacties (42)

[Verwijderd]

Deze discussie is ook al bij Slashdot geweest.
Interessantste vraag vond ik wat er met de resultaten gebeurt.

Je kan wel lief met zijn allen meehelpen, maar als een bedrijf vervolgens met de resultaten en de patenten wegloopt, dan zou ik me toch lichtelijk genaaid voelen, Zo'n bedrijf kan dan forse winsten maken met hulp van jou CPU time.

[S.Death]

Ja en is dat erg dan want jij weet dat jij hebt meegeholpen aan een cure. Dus laat hun lekker met de resultaten weglopen maar jij hebt wel meegeholpen aan de cure.
Jij help andere mensen.

[Verwijderd]

Nee, Turbonegro slaat precies de spijker op zijn kop.

Dat is namelijk ook precies de reden waarom ik huiverig ben om CPU-resources beschikbaar te stellen aan dergelijke projecten: ik zou dan kosteloos meehelpen met de bedoeling om een bijdrage te leveren aan de mensheid en niet om de kas van een multinational verder te spekken!

Als je kijkt naar hoe onfatsoenlijk die grote farmaceutische bedrijven zich gedragen, met name t.o.v. arme landen die bepaalde medicijnen het hardst nodig hebben maar niet kunnen veroorloven, dan wil ik me daar verre van houden.

Als er echter een commercieel initiatief zou komen vaarvan de organisator van te voren een agreement zou ondertekenen waarin staat dat ze alle uit dat project voorvloeiende producten tegen de kostprijs exclusief ontwikkelingskosten (dus zonder royalties) zouden aanbieden aan ontwikkelings- en derdewereldlanden, dan zou het voor mij een stuk interessanter zijn om mee te doen.

Helaas heeft het feit dat die armere landen geen geld hebben ook vaak als gevolg dat farmaceutische bedrijven liever research plegen op gebied van welvaartsziekten (omdat mensen die daaraan lijden veel meer geld hebben) dan aan bijvoorbeeld AIDS en ziektes die niet in rijke landen voorkomen.

[Qwerty-273]

OP het forum van d2ol staat vermeld wat ze met de SARS resultaten gaan doen, en daarmee kan je dus concluderen dat het gratis ter beschikking is voor iedereen en dat men er ook gelijk mee aan de slag gaat met de uitkomsten

[Skinkie]

Hoe serieus moet je dit nemen programma draait onder java... volgens mij staat die programmeertaal in geen verhouding met een snelle core... no flame intended.

[Wouter Tinus]

Het 'snelheidsverlies' van Java versus assembler zal ruimschoots opwegen tegen het aantal berekeningen dat gedaan wordt tijdens het verschil in ontwikkeltijd tussen die twee opties. Dit is nu eenmaal iets ingewikkelder dan RSA, laat staan om het met de hand in assembler te gaan bouwen voor tientallen platform/processor-combinaties.

[Gman]

En Java is platform onafhankelijk, alleen die memory load is een nadeel van Java.

[Ruuddie]

Ze mogen hun site wel eens wat sneller maken, want dit schiet niet op, een site met 5 kb/s openen

OMFG, nu ben ik bij 't downloaden aangekomen: 10.87 MB met 4.3 kb/s (heb ADSL basic, kan dus wel wat sneller aan )
Heeft niemand een mirrortje of zo? DAP vindt ook al geen mirrors...

[esvier]

idd... heeft iemand een miror... want het gaat nu echt traag!!!

edit:

lama heb d'r al een
195.241.84.246/zdnet/dlweek0318/D2OL_sarstool.exe 500 KB per sec

[Cybje]

Bij deze dan ook http://www.activedomain.nl/D2OL.exe

[S.Death]

Volgens mij heeft het THINK project een cure voor anthrax al gevonden hoor. Ze hadden volgens mij binnen 48 uur nadat het project gestart werd een cure gevonden.

Maar verwachte al dat er een distributed project van ging komen voor SARS

edit: ff opgezocht en het was 24 dagen.

[Freakertje]

KLeine correctie: Dat er een mogelijke kuur gevonden was. Het project loopt alle mogelijke kuren na, maar kijkt daarbij niet of het eiwit toevallig niet de rest van je lichaam ook ff meesloopt i.p.v. alleen het virus....

Dit project is slechts een theoretische handreiking voor het onderzoek naar DE kuur. Als er een mogelijke goede kandidaat gevonden is kan juist die extra getest worden om te kijken of het idd HET medicijn is tegen de ziekte.

[Qwerty-273]

Ik weet niet precies hoe THINK hun candidates opbouwt maar D2OL maakt hun candidate van vrijelijk beschikbare onderdelen. Iedereen kan deze dus gewoon (al dan wel natuurlijk ervaring en spullen nodig) deze candidates namaken. Vooral dit is een groot punt.

Je kan best een cure maken maar als deze te duur is om te produceren doordat er tal van veels te moeilijke constructies gebruikt worden tja. Dan heb je een cure, maar deze is wel te duur voor de gewone mens en zal daardoor dus ook niet massa geproduceerd worden door medical bedrijven.

[RocketKoen]

dat wordt nog een draaien
denk alleen niet dat dit op tijd komt voor veel mensen
edit: werkt btw ook aan een cure voor Anthrax

[Verwijderd]

Antrax is een prachtige Anglicaanse benaming voor miltvuur, en was dus ook al opgenomen in de tekst

Deze ontwikkeling kun je in principe alleen maar toejuichen, met de kanttekening dat juist de grote angst nou eigenlijk niet de aanleiding tot het participeren in een project met een dergelijk doel zou moeten zijn, maar elk project dat elke vreselijke ziekte of infectie probeert te verhelpen zijn eigen kleine beetje aandacht en respect zou moeten hebben.

[edit]

Voor de user boven me: Sars heeft een sterfratio van 3 procent. Tien is ietwat overdreven.

[Lief Adje]

waar haal jij 3% nau weer vandaan?? ik dacht dat het 5% was en in china zelfs 15%

[Puppetmaster]

gewoon rekenen he? kom je er vanzelf op dat het ca. 4 % is.
verder is SARS niet erg besmettelijk en goed met quarantaine te behandelen dus al die hype erover is wat overdreven.
er zijn bemettelijkere dodelijkere ziektes die meer slachtoffers eisen en waar we netzoveel tegen kunnen doen. alleen SARS is nieuw en een Media Hype...

[terracide]

Nee voor veel mensen niet. Maar voor helehoop anderen wel. Het wordt bijna niet ethisch verantwoord als je niet mee doet. Ik bedoel ,de kans is zeer groot dat dit virus miljoenen mensen gaat treffen. Met een sterf ratio van 10 % en een besmettings kans waar geen dieren voor nodig zijn maakt dit een zeer gevaarlijk virus.
Red je zelf en alle anderen zou ik zeggen.

[FireFly]

Het is ook een ethisch dilemma natuurlijk.
Ja laat nu je PC op volle toeren draaien terwijl je die anders misschien uitschakeld. Betekend ook meer electriciteits voorziening en die electriciteit wordt dan weer gemaakt met schade aan't milieu.
Dit wil niet zeggen dat ik 't niet doe, ik heb zo'n dingen tegen kanker lopen, maar wie redden we 't eerst : het milieu, of zullen we zelf ziek-vrij rondlopen in een kapot milieu.
(het gaat hier natuurlijk niet over 1 pc'tje hé)

[TheGhost]

ja daar heb je wel een punt, maar ik denk dat 't met de schade aan het milieu (specifiek door computergebruik dus) nog wel los loopt. Je kan beter eerst die ziektes onder controle zien te krijgen anders hoef ook niet naar 't milieu te kijken want daar heb je niks meer aan als iedereen dood gaat door allerlei ziektes (ja ik weet 't er worden ook mensen ziek door die verontreiniging)

[area32]

Maar het moet er toch ooit wel komen he
Hopelijk voor ik of vele anderen het krijgen

[Verwijderd]

De bedoeling is niet dat je je pc extra aan laat staan. Dat is je eigen keus, de afweging mbt het milieu moet je daarbij zelf maken.
Het idee is om computers die toch al aanstaan en maar voor 5% worden gebruikt helemaal te gaan gebruiken. De energiekosten zullen hierdoor niet explosief gaan stijgen, het energieverbruik en dus de milieuvervuiling ook niet.

Ook niet bij 1000'en en misschien nog wel meer computers tegelijk.
(het wordt wel veel meer, maar op de enorme berg die het was is dat niet zo indrukwekkend )

[Freakertje]

Het is de processor die hier het werk doet. Je computer gebruikt ondertussen bijna evenveel energie als dat ie normaal zou aanstaan. Ik dacht dat het hoogstens een paar Watt verschill zou maken, terwijl de computer zelf algauw 300 - 400 Watt verbruikt, monitor nog niet echt meegerekend...

[Hakker]

Er wordt al maanden gekletst voor een CLI versie van D2OL maar totdat die er niet is zullen veel mensen niet op het project overschakelen. Het vreet 90 MB aan geheugen op wat schandalig hoog is en als je gamed pakt ie gewoon nog teveel CPU power. Het is dus niet geheel een Distibuted computing project wat puur idle power gebruikt. Het kan gewoon zij dat de Java client daarvoor te traag reageert of gewoon teveel resources vreet.

[Verwijderd]

CLI only schijnt al te werken..het is alleen niet goed aangegeven.. het moet in de readme.txt staan hoe het moet..

Staat ook op hun forum in het development gedeelte..

[Witlof]

Hopelijk beseffen mensen nu dat het draaien van een 'koetje' toch enig nut kan hebben. Als je mee kan werken aan een project met een medische achtergrond denk ik dat dit wel erg goed is.

[mcB]

De link naar de FAQ geeft geen directe informatie over het project.
Klik hier om direct naar de projectbeschrijving te gaan.

[Verwijderd]

ik denk dat het commercieel gezien best interessant is om iets tegen AIDS te vinden...

en het is idd zo dat (sommige?) grote farmaceutische bedrijven achterlijk hoge prijzen vragen, maar door gratis CPU-power beschikbaar te stellen gaan die prijzen van achterlijk hoog misschien naar iets-minder-achterlijk hoog. En dat lijkt mij al een mooie verbetering. Het kost jou bijna niets aan geld, het levert je contacten op, een nieuwe hobby, met statistieken en grafiekjes en nog veel meer leuks
persoonlijk heb ik het er wel voor over.

voor de mensen die "klagen" over RAM-gebruik en dergelijke: er zijn ook projecten die minder (ja, haast geen) RAM gebruiken en echt alleen maar de overgebleven CPU-power pakken.