DPC: gezamenlijk vechten tegen kanker

Op 7 juni vorig jaar werd er met trots gemeld dat we met DPC door de 100 miljoen punten zijn gegaan bij het DC project van UD-Grid. Nu, één jaar verder, kunnen we met nog veel meer trots melden dat we de volgende formidabele mijlpaal hebben gehaald, namelijk 200 miljoen punten. Waar we over de eerste 100 miljoen punten ruim twee jaar hebben gedaan, hebben we nu dus evenveel punten in één jaar tijd kunnen behalen. Wat deze versnelling ons het afgelopen jaar heeft gebracht lees je verderop, nu eerst wat informatie over dit project.

Het UD-Grid project

In april 2001 is gestart met het United Devices (UD) Cancer Research Project. Dit non-profit programma zoekt naar medicijnen tegen verschillende varianten van kanker. Dit doet men bijvoorbeeld door de opbouw en afbraak van kankercellen te onderzoeken. Dit gebeurt door moleculen te selecteren die op een bepaalde manier reageren met vooraf geselecteerde eiwitten. De UD client simuleert deze reacties en stuurt de resultaten terug naar de servers van UD. De uitslagen daarvan kunnen dan in een later stadium verder onderzocht worden.

In de zomer van 2002 is de eerste fase van het project (THINK) afgesloten en is begonnen met de tweede fase (LigandFit). De moleculen die in de eerste fase van het project grof gefilterd zijn, worden nu opnieuw bekeken en aan andere, uitgebreidere onderzoeken onderworpen. Daarnaast loopt er ook een project dat onderzoek naar smallpox (pokken) doet. Dit staat los van het kankeronderzoek en hieraan kan optioneel worden meegedaan. DPC doet sinds het prille begin mee met het project en heeft altijd in de hogere regionen van de statistieken gestaan. Een jaar geleden stonden we negende en leek het erop dat we in de loop der tijd langzaam zouden zakken. Hoe anders is dit verlopen.

Het afgelopen jaar

Na het nieuwsbericht over de 100 miljoen mijlpaal werd DPC overspoeld met nieuwe leden, in totaal bijna 200. Tegelijkertijd werden we ingehaald door het team van DSL Reports, maar de achtervolging kon beginnen. Het bleek namelijk al snel dat alle nieuwe leden voor een flinke stijging in de output zorgden. In plaats van de vertrouwde negende plaats daily stonden we een paar weken later doorgaans zesde. Het duurde dan ook niet lang of we konden weer een plaatsje terugpakken, ten koste van [H]ardOCP. De rust keerde even terug en we werden zelfs opnieuw bedreigd, ditmaal door IBM Internal. IBM is sponsor van het smallpox project en doet hier ook actief aan mee. Het bleek dat DPC niet tegen deze blauwe reus op kon en in oktober zakten we wederom naar plaats tien. Maar uiteraard gaven we de moed niet op en rond de jaarwisseling kwam daarvoor de beloning. Kort achtereen waren het Japanse Techside.net en Hungary de klos en steeg DPC naar de achtste positie.

Op dit moment staan we hier nog steeds. Pal achter DSL en IBM, in wiens slipstream we redelijk mee konden komen. Sterker nog, in de dagelijkse standen staan we er tegenwoordig zo nu en dan voor. Graag zouden we in het totaalklassement verder stijgen, maar dit kan zoals het er nu naar uitziet nog wel een jaar of twee duren. Een nieuwe impuls zou dan ook zeer welkom zijn.

Meedoen?

Wie dit kankeronderzoek als een mooi project ziet om zijn pc voor in te zetten en graag meehelpt om DPC verder omhoog te krijgen, kan dit doen door de UD-client te installeren. Het programma is zo ontworpen dat het alleen maar gebruik maakt van de idle-time van je processor. Aan andere programma's op de computer wordt dus altijd voorrang gegeven. Ook als er niet veel van de computer gebruik wordt gemaakt heeft dit toch een groot effect als er veel mensen zijn die dit allemaal doen. Immers, vele kleintjes maken één grote. Dit kleine landje heeft al bewezen groot te zijn in Distributed Computing-projecten, maar daar hebben we wel hulp bij nodig.

Hier staan de instructies voor het installeren en instellen van het programma. Daarna is het alleen maar een kwestie van de computer aan laten staan om DPC te helpen. Voor verdere vragen kan men altijd terecht op ons forum op GoT, bijvoorbeeld in de laatste hitparade.