Hoofdcategorieën
Device Settings

DPC behaalt mijlpaal in strijd tegen besmettelijke ziekten

Door Mark Bloemendaal, donderdag 12 februari 2004 08:26
Bron: DPC Crew, views: 11.921

Gisteren hebben de Dutch Power Cows, het eigen distributed computing team van Tweakers.net, een grote mijlpaal behaald in het D2OL-project. Na hard werken werd de mijlpaal van 2.000.000 aangetikt, als tweede team ter wereld.

*Wat doet dit project precies?

D2OL logoD2OL staat voor Drug Design Optimization Lab en is gericht op het onderzoek naar mogelijke medicijnen voor de meest besmettelijke ziekten ter wereld. Het project begon met de drie meest besmettelijke virussen op aarde (die mogelijk gebruikt konden worden voor bioterrorisme), te weten ebola, pokken (smallpox) en miltvuur (anthrax). Ten tijde van de SARS-uitbraak in Azië werd het project hierop gefocust vanwege de actualiteit en de dringende noodzaak naar onderzoek voor deze ziekte. Als laatste virus is malaria toegevoegd aan het project, dat volgens het WHO verantwoordelijk is voor 2,1 procent van de sterfgevallen op aarde, en daarmee na aids en tbc de meest dodelijke ziekte op aarde is. Op dit moment is het project niet echt toegespitst op één ziekte en wordt er actief naar medicijnen voor elk 'target' gezocht.

*Hoe gaat dat in z'n werk?
Het project probeert voor deze ziekten medicijnen te vinden met behulp van het sleutelgat/sleutel-principe. De client downloadt een library met informatie over een specifieke verschijning van een ziekte. Vervolgens gaat de client aan de hand van de molecuulvorm allerlei moleculen die de ziekte onschadelijk zouden kunnen maken, erop 'passen'. De twintig moleculen die hiervoor het meest geschikt worden bevonden (conformers) worden dan gebundeld (candidates) en weer naar het project teruggestuurd. De wetenschappers bij The Rothberg Institute, dat het project leidt, analyseren vervolgens de informatie en gaan ermee aan de slag. Zo dragen we bij aan onderzoek naar die ziekten en het ontwikkelen van medicijnen ervoor.

*Hoe doen we het in de stats?
Op dit moment staan we tweede wereldwijd, achter onze grote vrienden van Team Anandtech (een beetje een kwestie van oud zeer dus ). Verder doet onze achtervolger dagelijks meer dan wij, dus rooskleurig is het op dit moment niet. Een overzichtje van de overall output en de dagelijkse output:

TeamOverallDaily
Team Anandtech2,5 miljoen13.000
Dutch Power Cows2 miljoen8.000
Team Norway (Norge)1,5 miljoen11.000

Gelukkig kunnen we melden dat de stampede nog bezig is waar ook veel D2OL'ers aan mee doen. Deze loopt vrijdag 13 februari om middernacht af en daarna belooft het bij D2OL een spannende strijd te gaan worden met onze vrienden van Team Anandtech. Wil jij ook mee doen om net als vroeger (in de tijd van RC5-64) Team Anandtech te verslaan en de eer van Dutch Power Cows hoog te houden? Installeer dan snel de client!

*Je hebt me overtuigd! Een nuttig doel, een leuke strijd in het vooruitzicht, hoe doe ik mee?
Molecuul
Dat is makkelijk. Download de client hier (beschikbaar voor Windows, Linux, Mac OS X en Solaris) en installeer hem met behulp van dit stukje uit de FAQ. De client is erg gebruiksvriendelijk, dus veel problemen zul je niet tegenkomen. Mocht je nog vragen hebben of meer informatie willen dan kan je die in dezelfde FAQ vinden. Je kan natuurlijk ook je vraag in een D2OL-hitparade op het DPC-forum op Gathering of Tweakers stellen .

Volgende 08:47 Wanadoo laat positieve resultaten zien
Vorige 03:38 AMD CEO Hector Ruiz voorgedragen als voorzitter RvB
Advertentie

Reacties

«  1  2  3  »

FYI: Malaria is een parasiet, geen virus.

-edit-

ocf81 je hebt toch gelijk, ik was weer iets te snel met mijn reactie.
|:(

Van het Amerikaanse Centre Of Deasease Control
Malaria (mah-LARE-ee-ah)

What is malaria?

Malaria is a serious, sometimes fatal, disease caused by a parasite.

Correct me if i'm wrong maar volgens mij is Malaria een vrius dat wordt overgedragen door een parasiet nl. de malaria mug.

Malaria zelf is dus geen parasiet.

Malaria wordt veroorzaakt door protozoa: Plasmodium vivax, ovale, malariae, falciparum, die enkel de mens als gewervelde gastheer hebben. Occasioneel kunnen ook Plasmodia van apen de mens besmetten, met in ernst sterk variërende ziektebeelden. De levenscyclus van de Plasmodia is complex. Plasmodium vivax en ovale vertonen bovendien persisterende slapende levervormen ('hypnozoïeten') na infectie en klinische genezing, die lange tijd later en zonder nieuwe infectie tot een nieuwe malaria-aanval kunnen leiden. Binnen de species is er nog belangrijke genetische variatie, wat aanleiding geeft tot multipele 'strains'.
bron: http://users.skynet.be/paul.demunter/Malaetio.html#Epi

Oftewel, parasieten dus :)

En wel 10 tot 15 micrometer lang, hebben hun eigen stofwisseling, hoeven dus niet van de productiefaciliteiten van "gast"cellen gebruik te maken zoals virussen dit doen. Hebben zelfs hun eigen mitochondrieen (dit zijn een soort energiecentrales die ook in onze cellen zitten).

[edit] @MachoM Volgens jouw url naar people.ku.edu is een virus: "A virus is not strictly alive.. nor is it strictly dead... A virus has some fundamental information (genes made of DNA or RNA) which allows it to make copies of itself. However, the virus must be inside a living cell of some kind before the information can be used"
Oftewel, heeft geen eigen synthese. Dat heeft een parasiet wel. {/edit]

Geloof me het is een virus, een virus heeft namelijk ook gastheer en is in weze een extreem kleine parasiet. (Op het cel niveau.)

zie ook: http://people.ku.edu/~jbrown/virus.html

het is een protozoa, dus geen virus.

Een koe is een dier , dus alle dieren zijn koeien?
Een virus heeft parasitaire capaciteiten, maar dat wil niet zeggen dat alle parasieten virussen zijn.Het protozoa zoals de malaria parasiet, is een eencellig wezen, geheel self supporting en duizenden malen groter dan het gemiddelde virus dat vaak niet meer is dan een strengetje dna en wat eiwit ;)

Nee, je gaat er niet noodzakelijkerwijs dood van.

Jullie hebben allemaal gelijk, ik had beter een ander woord kunnen kiezen. Hier heb ik een mooi stuk geschreven over wat malaria precies is. Misschien interessant voor sommige mensen?

Toch fijn dat we de 2miljoen hebben gepasseerd. Tot hoeveel moeten we voordat er een medicijn is?

4miljoen zoiets denk.

Dat is niet te zeggen (helaas!). Van elke ziekte is een library die we helemaal moeten doorwerken, maar er is geen garantie dat er dan een medicijn beschikbaar is. Wel kan er met de gevonden informatie beter en gerichter onderzoek gedaan worden, dus dat is al een enorm voordeel!

Verder doet onze achtervolger dagelijks meer dan wij, dus rooskleurig is het op dit moment niet.
Dutch Power Cows 2 miljoen 8.000
Team Norway (Norge) 1,5 miljoen 11.000
Ja, een half miljoen verschil met een daily output verschil van 3000. Dat duurt nog dus zo'n 167 dagen voordat jullie worden ingehaald. :+
"Niet rooskleurig" pfff :P

Ik zie anders liever een doorbraak dan een mijlpaal...

Zeker waar! Maar statistieken is het enige resultaat wat je als gebruiker op korte termijn krijgt, en dan is het leuk om zo'n mijlpaal in de schijnwerpers te zetten! Zo krijgt het project wat aandacht, doen er meer mensen mee en komt er eerder een doorbraak! :)

Hoe nuttig zo'n project ook is. Ik vind 80-90 Mb aan geheugen voor zo'n client toch echt een drempel om er op over te stappen. (zelf heb ik wel genoeg, maar ik heb ook pc's staan die maar 128 of 64 mb geheugen hebben)

(@ Mar hieronder: ik doe nu inderdaad df :) daar kan je tenminste kiezen of je voor weinig geheugen of voor de volle mik gaat)

Misschien is Distributed Folding dan iets voor jouw en je Pc's? Ook een zeer nuttig medisch project en die client heeft iets minder geheugen nodig

Ik geloof dat ik mijn SETI-client maar van me pc afgooi en ga meewerken aan dit project.

Zodra ik vanavond thuisben zal ik SETI wegdoen en deze client installen :)

Hij ziet het licht, seti heeft toch eigenlijk totaal geen nut.

Het is maar hoe je het ziet, SETI is wel verantwoordelijk voor het populair maken van Distributed Computing onder ons eenvoudige mensen :)

Ik heb mezelf maar even voor dit project gerecht en een Node geinstaleerd... Deed al een tijdje nix meer voor DPC.. Dit lijkt me wel een leuk project maar vooral nuttig project.

Op naar de 3M!

Dit lijkt me wel een leuk project maar vooral nuttig project.
Helemaal mee eens, daarom doe ik ook mee.
:*)

Als alle tweakers ff een hondert euro lappen p persoon kopen we toch ff een Opteron cluster??

Staan we zo weer eerste :+

Hoevel procs??? 256 of zullen we er maar meer nemen??

We kunnen mss beter een cheape apple cluster kopen... ik weet mss nog wel ergens een tweedehandsje ;)

Zullen we deze dan maar bij jou thuis aanlaten staan :P lekkere stroom rekening krijg je dan :+

Dat verdien je wel terug als je je cluster goed gebruit, vermoed ik. Maarja dan kan je hem weer niet helemaal aan dit onderzoek besteden |:(

Zonde dat er geen console versie van is en dat Java VM een vereiste is. Anders had ik heel wat servertjes kunnen voorzien van deze client, welke aan dit bijzonder mooie project hadden kunnen bijdragen. Helaas :(

Inderdaaad jammer. We zijn aan het lobbyen voor een java vrije client, maar het zit er niet in ben ik bang. ;(

Misschien heb je wel een thuis pctje waar je het op wil proberen?

Ik doe vanaf nu ook mee...
P4 3,3 ghz met 1GB ram....

Mag ik nu ook Mooooouuuuhhhh zeggen?

Zeker weten! ;) Heb je ook een GoT account? Laat dan ff wat horen in de D2OL hitparade van vandaag! Het D2OL-team is een leuke club en 't is leuk om een beetje contact met elkaar te hebben :)
«  1  2  3  »

Op dit item kan niet meer gereageerd worden.

Volgende 08:47 Wanadoo laat positieve resultaten zien
Vorige 03:38 AMD CEO Hector Ruiz voorgedragen als voorzitter RvB
VNU Media logo Hosted by True

© 1998 - 2012 Tweakers.net B.V. - Alle rechten voorbehouden - Contact - Jouw privacy - Algemene Voorwaarden

Uitgever van:

Website van het jaar 2011