Hoofdcategorieën
Device Settings

Belangrijke mijlpaal voor DPC in het onderzoek naar kanker

Door Mark Bloemendaal, zaterdag 7 juni 2003 13:32
Bron: Dutch Power Cows, views: 944

3 april 2001 is de dag waarop de Dutch Power Cows, Nederlands grootste distributed computing team, begon aan de projecten van United Devices (ook wel UD Grid genoemd). Vandaag, twee jaar en drie maanden later, hebben de Dutch Power Cows een belangrijke mijlpaal bereikt bij deze projecten. Als negende team wereldwijd heeft DPC de barrière van 100 miljoen punten doorbroken (zie hier). Daarvoor hebben we ruim 888 jaar processortijd nodig gehad. Dit is dus een hele prestatie! Maar de negende plaats is DPC natuurlijk onwaardig.

* Het Project

United Devices en Intel hebben, in samenwerking met de University of Oxford Chemistry Department een non-profit programma opgezet, dat de overgebleven processorkracht (de zogenaamde 'idle time') van je computer gebruikt om te zoeken naar een medicijn tegen kanker (leukemie om te beginnen). In april 2001 is het onderzoek gestart met de eerste fase van het project, met behulp van de analysemethode THINK. In deze fase werden ongeveer 3,5 miljard moleculen oppervlakkig gescand op sommige eigenschappen, met als doel de meest kansrijke kandidaten voor een medicijn te selecteren. In de zomer van 2002 is de tweede fase van start gegaan, met een andere analysemethode, namelijk LigandFit. De moleculen die in de eerste fase van het project grof gefilterd zijn worden opnieuw bekeken en aan andere, uitgebreidere onderzoeken onderworpen.

UD is onlangs naast het onderzoek naar kanker ook begonnen aan een nieuw project, dat zoekt naar een medicijn voor het pokkenvirus (Smallpox), waarbij ook van de LigandFit analysemethode gebruik gemaakt wordt. Standaard zal de client zowel werk verrichten voor het onderzoek naar kanker, als voor het onderzoek naar het pokkenvirus. Dit is echter in de instellingen te wijzigen, als je liever alleen aan het kankeronderzoek meewerkt. Dit doe je door in te loggen op de UD Member site en via My device manager en dan Profiles het vinkje weg te halen bij PatriotGrid. Meer info over dit project op het Grid.org forum.

*De Tussenstand

Inmiddels heeft UD meer dan 2 miljoen leden waaronder 1.892 DPC'ers. De kans bestaat dat DPC nog gaat stijgen in de ranglijsten, maar de kans dat we gaan zakken is helaas groter. Twee teams die nu nog onder DPC staan leveren dagelijks een grotere bijdrage aan het project dan DPC doet. Waarschijnlijk zullen we binnen nu en een week een plekje af moeten staan aan het team "DSL Reports Team Discovery". Een kleine drie maanden later zal het team "IBM Internal", volgens de huidige stand van zaken, ons ook voorbij gaan, waardoor we zelfs uit de toptien verdwijnen. Pas anderhalf jaar later hebben we dan weer zicht op het terugkeren in de toptien. Alle hulp is dus welkom om DPC in de toptien te houden! Daarnaast help je (moeiteloos)ook nog eens mee aan een goed doel, want de kans is 25% dat je ooit in je leven zelf te maken krijgt met kanker.

Wil je aan dit project meedoen? Check dan de FAQ of kijk op GoT waar iedereen je graag helpt met het beantwoorden van je vragen.

Volgende 13:45 Zoekmachine Vindex overgenomen door Ilse Media Group
Vorige 12:58 Breedbandgebruikers zijn nog steeds roekeloos
Advertentie

Reacties

«  1  2  3  »

'Scuse me: langlopend project; weinig nieuws; propaganda voor DPC.

Desondanks: het nobele streven is nog steeds nodig; dat ben ik zonder meer met iedereen eens!

Beetje misleidende titel alleen. Als je het leest zou je kunnen denken: "Mooi!! ze hebben nu blijkbaar inderdaad een medicijn gevonden". Helaas dus nog geen werkelijkheid.

Ik hoop wel dat TN de volgende keer kan melden: Belangrijke mijlpaal voor DPC: werkend medicijn tegen kanker ontdenkt

Allemaal nog even door-assimuleren dus.

Inderdaad misleidende titel. Verder vind ik dit ook niet echt een nieuwspost en alle informatie kan ook in het forum gevonden worden, of in de post van 2 weken geleden

Ik ben wel blij dat sinds het einde van 2002 geen dagelijkse verslagen meer komen over de DPC projecten. Dan heb ik liever deze post die naast propaganda toch wel wat leuke informatie geeft. :)

Wat is mis met de titel, voor DPC is dit een grote gebeurtenis. En wat maakt jou zo blij dat er geen dagelijkse post over DPC meer zijn :? Je kan er zo aan voorbij gaan hoor. Ik snap het uberhaupt niet dat mensen zich storen aan posts over DPC. T.net is DPC en DPC is T.net, ik vind het een groot gemis dat er niet meer dagelijks een DPCH te vinden is op de frontpage.

Goed bezig :) petje af, ik moet ook maar eens een }:O laten lopen op mn PC.

Allé dat is goed nieuws, mijn pc'tje draait al meer dan een jaar met dat United Devices proggy en ik zie da maar punten genereren, maar nu hebben ze eindelijk resultaat bereikt. Way to go!

Nou, ik zoek al 4 jaar naar aliens zonder resutaat, enige wat ik heb gevonden is me broertje :9

nutteloos dus }:O ;)

leuk :)

maar ik dacht dat besloten was geen reclame meer te maken voor de distributed projecten??


Duh staat er toch bij:
In deze fase werden ongeveer 3,5 miljard moleculen oppervlakkig gescand op sommige eigenschappen, met als doel de meest kansrijke kandidaten voor een medicijn te selecteren.

Je kan natuurlijk op de linkjes klikken en het zelf lezen...

door de inwerking van bepaalde stoffen op een kankergezwel te simuleren. men weet uit welke stoffen een kankergezwel bestaat en waaruit een geneesmiddel bestaat. Maar deze chemische reacties simuleren kost veel rekenkracht. Zeker als je weet hoeveel verschillende combinaties van chemische stoffen, die ze eiwitten e.d., noemen er zijn. Door je pc-tje als je hem zelf niet gebruikt zo enkele van die eiwitten te laten onderzoeken kan je meewerken aan een cure tegen kanker.
Of ebola, small pax, sars zoals het D2OL project doet.

Er zijn gewoon dringen meer nieuwe leden nodig. Ofwel moeten we ons er bij neerleggen dat we op sommige plaatsten achteruit gaan. Want als iedereeen die een }:O op zijn pc heeft draven kom je denk ik niet veel vooruit door er meerdere te laten lopen. Zelf heb ik enkel het D2OL project lopen. Stel dat ik er daar nog 5 andere naast zet wordt mijn idl verdeeld. Geen echte winst in het algemeen dus.
Dus meer leden aantrekken is de boodschap :)

Ik ben ervan overtuigt dat hier het probleem bij is dat er teveel distributed projecten zijn.

Vroeger had je RC5-64 en Seti challanges. Meeste tweakers deden rc5. NU is dat voorbij en schieten ze als bloemetjes uit de grond. ja welke kies je nou als tweaker zijnde?

Ook dpc doet hier vroolijk aan mee. 10-15 verschillende stats etc op de site. Bundel je forces naar 1 iets en ga niet alles zitten verspreiden.

Toegegeven, als je klaar bent heb je wel 10-15 dingen
klaar, maar als je daar 100jaar voor nodig hebt schiet dat natuurlijk niet op.

so dpc, bundle your forces.

Niet iedereen voelt zich aangetrokken tot RC5 bv. Door de vele projecten heb je ook veel variatie in je aanbod en dat is alleen maar positief naar mijn mening. Zo kan iedereen doen wat hij/zij leuk/nuttig vindt om te doen.

Als je je puur wilt focussen op 1 of 2 projecten dan zou je mensen moeten gaan dwingen een bepaald project te doen en dat gaat hier, waarbij we afhankelijk zijn van een welwillend persoon die zijn pc wil afstaan voor dit soort doeleinden, niet gebeuren.

Ben ik het mee eens :)

En ik denk dat de UD-client uitstekend geschikt is om te dienen als dé DPC-project Client, waar dus eigenlijk álle DPC'ers aan mee moeten doen! Ik heb het progje ook een tijdje gedraaid, het werkt soepel, en vreet nauwelijks andere system resources dan processor idle time.

Goed beschouwd zijn projecten als RC5-72 alleen maar leuk voor de stats..... en toch doen daar de meeste DPC'ers aan mee. Misschien idd eens tijd om de Distributed Computing projecten waar de mensheid écht wat aan heeft meer te promoten, en langzaam maar zeker de 'nutteloze' projecten uit te faseren.

Beetje jammer dat er in dit artikel nog zoveel de nadruk gelegd wordt op het 'stats' gebeuren. Lekker boeiend dat DPC 9e of 10e is en wellicht wel 11e wordt :o :z
Waar het dus om gaat is dat er met het draaien van de UD client mensenlevens gered kunnen worden! Dat mag toch wel VOOROP staan :)

Dan kunnen we Team_Switch ook wel afschaffen!
Geen goed idee dus!!

Ik vind dat je nu wel heel erg overdrijft. 10 à 15 projecten is wel iets anders dan 10.000. En als je geen variateit had gehad dan denk ik dat een groot gedeelte van de mensen die nu zo'n ander project doen niet hadden meegedaan met welk project dan ook, gewoonweg omdat niet iedereen dezelfde projecten leuk vinden.

Het was mijn bedoeling ook om te overdrijven, en dat op zo'n manier dat het erg duidelijk was dat het overdreven is. Ik heb het voor je aangepast : P

En de keuze welk project je aan mee doet, maakt dit echt uit? Vind jij het echt zo belangrijk dat de rc5-72 bits sleutel gevonden word? het is toch maar een kwestie van tijd. Of dat er aliens gevonden worden, nou is dat nog wel geinig, maar projecten die zoeken naar een medcijn tegen kanker lijkt me toch aanzienlijk belangrijker dan die anderen.

En je dwingt mensen .... je installeert een programmatje en dat rekent. merk je er echt van wat ie rekent? voor het zelfde geld zitten we met zn allen via alle projecten geheime FBI shit te decoden en niemand die het weet.

Er staat dat de DPC's 888 jaar processortijd hebben geinvesteerd. Waar wordt dat op gebaseerd? Één jaar computertijd voor een P100 is wel wat anders dan voor een P4 3Ghz... Of is er een bepaald aantal berekeningen gelijkgesteld aan een jaar processortijd?

Of je een P100 een jaar laat rekenen of een P4 3Ghz... een jaar processortijd blijft een jaar processortijd.

Werknemers werken ook niet allemaal even snel maar daarom kan je nog wel een x aantal arbeidsjaren achter de rug hebben.

Blijkbaar wordt gewoon de uptime van de UD client gemeten, daar zijn geen moeilijke berekeningen voor nodig hoor!

En het maakt dan ook helemaal niet uit om wat voor processor het gaat, immers alleen de tijd dat het progje draait is van belang :)

Processortijd is processortijd, of dat nu met een AMD K6-2-400 is of een P4 3.06.
In dit project krijg je echter wel meer compensatie voor een tragere processor, het is dus niet zoals bij RC5-72 dat je eigenlijk een hele snelle machine moet hebben. Wij hebben een aantal servers draaien (P2-400, P2-450 en P4-1.6) en die scoren nagenoeg hetzelfde, daarom is het voor de leden ook laagdrempeliger om mee te doen met UD-THINK.

Wat overigens nog niet is vermeld is het volgende:
1. Je doet mee met een nuttig onderzoel, je zoekt naar een medicijn tegen ziekten die we nog niet de baas zijn. Hiermee kan je potentieel levens redden en dat is heel wat nobeler dan domweg een sleutel voor een DB proberen te kraken met brute-force (en dat schiet ook niet op).
2. Bij dit project maak je al snel leuke scores, mijn teampje heeft nu ongeveer 18 machines draaien, waarvan ongeveer 60% een dagelijkse output heeft. Toch staan we hiermee al een tijdje in de dagelijkse top30. De laatste dagen hebben we een aantal machines die wat langer hebben gedraait dan normaal en we halen nu dan ook de top10. Met een relatief klein aantal systemen kan je dus echt al leuk meedoen.
3. Er is een hele leuke sfeer tussen een aantal subteams: Op het moment is er bijvoorbeeld een 'race' naar de 150k punten, wat ongeveer een dag of 40-50 zal duren. Door deze race leer je elkaar wat beter kennen en probeert iedereen toch weer een extra machine mee te laten doen. Goed voor de sfeer, goed voor de resultaten en goed voor het project.

Als ik kijk naar RC5-72, zie ik dat DPC hardstikke voorloopt op de rest, tof natuurlijk, maar ook de dagelijkse output is zo veel groter dat DPC voorlopig niet wordt bijgehaald. Misschien is het (naast het feit dat RC5-72 weinig nut heeft) daarom wel leuker om je te concentreren op iets wat nut heeft voor de samenleving. :)

De 150k race roeleert :P Volgens de stats van vandaag duurt het nog maar 38 dagen, maar het e.a. zal wel binnen 33 dagen gefixed zijn :D

Anyway doe mee aan de volgende race! Log samen met je buurman of je zusje in en je hebt al 4 systeempjes pruttelen. DPC against Cancer!

Bij de puntentelling van grid.org wordt het aantal gecrunch'te pakketjes gewogen tegen de processortijd. Meer CPU power levert dus niet direct meer punten op ;-)

Het is dus ook niet belangrijk met wat voor Proc's je aan je punten komt..

Zolang je maar binnen 8 dagen een workunit af kunt maken. Want dat is wel een eis. Daarom heeft een 386 ook niet zoveel zin, maar alles vanaf een P200 scoort gewoon hardstikke leuk :)

Fout, in de FAQ staat:

De client mag 264 uur (11 dagen) over een WorkUnit doen, en een WorkUnit moet binnen 456 uur (19 dagen) bij UD terug zijn.

Meedoen? De UD Agent voor Windows is hier te downloaden.

Aanmelden bij DPC kan vervolgens via deze pagina.

Ik doe al een tijdje niet meer mee aan dpc :o omdat ik niet echt de toegevoegde waarde erin zag. Deze toepassing daar kan ik me wel in vinden. Ik heb nu m'n net nieuwe p4 2,4@3,1 toegevoegd aan de dpc for cancer.

Ik merk de belasting minder dan bij andere clients, of het kan zijn dat ik het minder merk op deze compu tov m'n vorige 1,3 celeron.

Dat laatste.
De programmatjes die op de achtergrond draaien voor de nuttige projecten zijn wat geheugengebruik intensiever dan de 'nuttelozere' projecten waarbij alleen maar naar getalletjes wordt gekeken, al dan niet in een wiskundige formule.
Het berekenen aan eiwitten en proteines is dusdanig ingewikkeld dat je met een klein programmatje niet uit de voeten komt.
(Dat is ook de reden dat de meeste mensen die van 1 van de d.net projecten afkomen klagen dat de andere projecten zoveel resources opvreten)
Maar als het goed is gebruikt het programma wat op de achtergrond draait alleen je idle-cycles van de CPU dus je zou er helemaal niks van moeten merken tijdens gewoon gebruik, mits je voldoende geheugen hebt in je pc.
«  1  2  3  »

Op dit item kan niet meer gereageerd worden.

Volgende 13:45 Zoekmachine Vindex overgenomen door Ilse Media Group
Vorige 12:58 Breedbandgebruikers zijn nog steeds roekeloos
VNU Media logo Hosted by True

© 1998 - 2012 Tweakers.net B.V. - Alle rechten voorbehouden - Contact - Jouw privacy - Algemene Voorwaarden

Uitgever van:

Website van het jaar 2011